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浙江大学沃森基因组科学研究院 收藏

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研究主题:基因组    水稻    测序    合成生物学    家猪    

研究学科:生物科学类    自动化类    

被引量:84H指数:4WOS: 7 EI: 5 北大核心: 13 CSCD: 13

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23 条 记 录,以下是 1-10

水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族同义密码子使用偏好的比较
1
《作物学报》浙江大学农业与生物技术学院农学系;浙江大学沃森基因组科学研究院 张晓峰 薛庆中  出版年:2005
国家自然科学基金 (3 9870 42 1);浙江重点课题 (2 0 0 3C2 2 0 0 7);浙江省 0 4 0 6水稻品种改良攻关项目资助
应用软件CodonW ,对全基因组进行分析,鉴定出水稻和拟南芥NBS -LRR基因家族的最优密码子分别为2 5和16种。NBS- LRR基因家族与其全基因组的最优密码子一致,但两个物种间彼此完全不一致,密码子使用上发生偏...
关键词:水稻 拟南芥 NBS-LRR基因  密码子用法
肿瘤基因组学与全球肿瘤基因组计划 ( EI收录)
2
《科学通报》中国医学科学院肿瘤医院/肿瘤研究所;深圳华大基因研究院;浙江大学沃森基因组科学研究院;北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所分子肿瘤学研究室 胡学达 杨焕明 赫捷 吕有勇  出版年:2015
DNA序列的变异是所有肿瘤细胞发生的重要的分子层面的原因,当前学界已经有能力对一定规模的癌症队列样本开展全基因组变异图谱的分析.国际肿瘤基因组协作联盟(ICGC)于2007年成立并启动了全球范围的肿瘤基因组研究工作.IC...
关键词:肿瘤基因组  国际肿瘤基因组协作联盟  中国肿瘤基因组协作组  测序 突变  
基于离散Hopfield网络求解极大独立集的茎区选择算法以及在RNA二级结构预测中的应用 ( EI收录)
3
《计算机学报》浙江大学沃森基因组科学研究院;浙江大学计算机科学与技术学院 刘琦 张引 叶修梓 俞荣栋  出版年:2008
提出了一种利用离散Hopfield网络求解图论极大独立集的启发式算法,并将其应用于RNA二级结构的茎区选择和预测当中.算法通过映射RNA序列的茎区为无向图中的节点,将预测RNA二级结构的问题转化为求解图的极大独立集的问题...
关键词:RNA  二级结构  极大独立集 离散HOPFIELD神经网络 茎区
基于Apriori算法的关键词推荐在面向主题的用户个性化搜索中的应用 ( EI收录)
4
《模式识别与人工智能》浙江大学沃森基因组科学研究院;浙江大学计算机科学与技术学院 刘琦 卜佳俊 陈纯  出版年:2006
对传统协作过滤方法在关键词推荐系统中的应用进行分析.在 Apriori 算法的基础上,提出一种面向主题的用户个性化搜索的关键词推荐算法.该算法基于 Apriori 算法,对用户的搜索历史关键词集合进行频繁集挖掘.实验证明...
关键词:个性化 APRIORI算法 关键词 搜索引擎
LZ-8蛋白的原核密码子优化表达及免疫调节功能的初步检测
5
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》浙江大学沃森基因组科学研究院;北京基因组研究所 黄俊 张灵霞 胡松年 于军  出版年:2008
为研究LZ-8蛋白的免疫调节活性,设计合成12个寡核苷酸片段,并用PCR方法将它们连接为经密码子优化的新LZ-8基因;将该新基因克隆至原核表达载体pET-28b,构建重组表达质粒pET-28b_lz8,并在大肠杆菌BL2...
关键词:原核表达 密码子优化 真菌免疫调节蛋白  LZ-8蛋白  免疫抑制活性
泌乳前后家猪乳腺基因表达谱的构建以及不同猪种和不同发育时期差异表达基因的确定
6
《中国科学(C辑)》浙江大学沃森基因组科学研究院;温州师范学院生命与环境科学学院 苏志熙 董新姣 张兵 曾燕舞 傅衍 于军 胡松年  出版年:2005
科学技术部"863"国际合作项目(批准号:2002AA229061);中国科学院知识创新重大项目(批准号:KSCX1-01)资助
构建了不同猪种、不同发育时期的非标准化家猪乳腺cDNA文库,并从中获得28941条高质量ESTs(expressed sequence tags).利用序列拼接软件CAP3,这些EST序列被拼接成2212条重叠群和564...
关键词:表达序列标签  表达谱 家猪 乳腺 差异表达基因 基因表达谱 发育时期  猪种 构建  EST序列
吗啡的合成生物学研究和工业化生产 ( EI收录)
7
《科学通报》深圳华大基因研究院;浙江大学沃森基因组科学研究院 范楚珧 刘龙英 沈玥 陈泰 曾筱凡 杨焕明  出版年:2016
国家高技术研究发展计划(2012AA02A708)资助
吗啡是鸦片中重要的生物碱,其合成生物学制造及相关工业化生产,是合成生物学领域继人工合成青蒿素之后最有代表性的实例.本文从吗啡合成的有关代谢通路的阐明和设计开始,总结整理吗啡在酵母中的生物合成方法,介绍这一划时代工作的全过...
关键词:吗啡 酵母 生物合成 合成生物学 工业化生产  
两种家猪心脏组织基因表达谱的分析
8
《Acta Genetica Sinica》浙江大学生命科学学院;浙江大学沃森基因组科学研究院杭州华大基因研发中心;浙江大学农业与生物技术学院 曾燕舞 傅衍 张兵 苏志熙 张晓峰 胡松年  出版年:2004
中国-丹麦家猪基因组计划~~
选取丹麦成年长白母猪的心脏、肌肉、主动脉、左心室和中国成年二花脸母猪心脏共 5种组织 ,建立相应的cDNA文库 ,在此基础上测定了 35 180条表达序列标签。通过比较分析长白猪 4种组织的基因表达 ,找出了长白猪心脏组...
关键词:表达序列标签 表达谱 家猪 心脏 肌肉
SARS冠状病毒CT基因型发现及相关特征
9
《浙江预防医学》浙江省疾病预防控制中心;浙江大学卫生部传染病重点实验室;浙江大学沃森基因组科学研究院/杭州华大基因研发中心;中国军事医学科学院 李兰娟 王志刚 卢亦愚 程苏云 吴南屏 翁景清 张严峻 严菊英 梅玲玲 王晓萌 朱函坪 李敏红 姚军 陆群英 姚苹苹 史雯 汤鋆 葛琼 龚黎明 沃健尔 包其郁 余迎朴 俞鸿 王建斌 庄树林 张兵 张晓峰 苏志熙 曾燕舞 彭春龙 蒋琰 陈欢 李金宏 叶杰华 田薇 胡松年 陈苏红 张敏丽 伯晓晨 丁丽 樊玉伟 孙偶军 李鲁 王升启  出版年:2003
浙江省科技厅和浙江大学科研基金资助项目
目的 研究SARS冠状病毒基因型及相关特征。方法 对杭州市首例SARS病人分离的SARS冠状病毒ZJ0 1株进行全基因组测序 ,并在GenBank数据库登录。记录号 :AY2 970 2 8,版本号 :gi:3 0 91...
关键词:SARS  冠状病毒 严重急性呼吸综合症 传染性非典型肺炎 基因多态性  基因突变  CT 基因型
寻找水稻DNA编码与非编码区边界方法的比较研究
10
《遗传》浙江大学理学院数学系;中国科学院理论物理研究所;浙江大学沃森基因组科学研究院 孙奕钢 高雷 张忠华 薛庆中  出版年:2005
国家自然科学基金(编号:39870421);浙江省重点科研项目(编号:2003C22007)~~
在分析DNA序列复杂度、预测基因编码区和非编码的DNA边界识别等问题中,以熵为基础构造的离散量度量提供了一种强有力的工具。为改进寻找水稻基因编码与非编码区边界的效率,提出了两个新的离散量度量(αKL离散量与αJensen...
关键词:Jensen-Shannon离散量  Jensen-Renyi离散量  α-KL离散量  α-Jensen-Shannon离散量  GO含量  编码与非  编码区 水稻
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