文献类型：期刊文章

作　　者：李兰娟[1] 王志刚[1] 卢亦愚[1] 程苏云[1] 吴南屏[2] 翁景清[1] 张严峻[1] 严菊英[1] 梅玲玲[1] 王晓萌[1] 朱函坪[1] 李敏红[1] 姚军[1] 陆群英[1] 姚苹苹[1] 史雯[1] 汤鋆[1] 葛琼[1] 龚黎明[1] 沃健尔[2] 包其郁[3] 余迎朴[3] 俞鸿[3] 王建斌[3] 庄树林[3] 张兵[3] 张晓峰[3] 苏志熙[3] 曾燕舞[3] 彭春龙[3] 蒋琰[3] 陈欢[3] 李金宏[3] 叶杰华[3] 田薇[3] 胡松年[3] 陈苏红[4] 张敏丽[4] 伯晓晨[4] 丁丽[4] 樊玉伟[4] 孙偶军[4] 李鲁[4] 王升启[4]

机构地区：[1]浙江省疾病预防控制中心,浙江杭州310009 [2]浙江大学卫生部传染病重点实验室 [3]浙江大学沃森基因组科学研究院/杭州华大基因研发中心 [4]中国军事医学科学院

出　　处：《浙江预防医学》

基　　金：浙江省科技厅和浙江大学科研基金资助项目

年　　份：2003

卷　　号：15

期　　号：8

起止页码：3-5

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的　研究SARS冠状病毒基因型及相关特征。方法　对杭州市首例SARS病人分离的SARS冠状病毒ZJ0 1株进行全基因组测序 ,并在GenBank数据库登录。记录号 :AY2 970 2 8,版本号 :gi:3 0 910 85 9。整个全基因组由 2 9715bp组成。使用GenBank数据库中最新登陆的SARS病毒的基因组进行序列比对、突变点分析和多态性分析、特殊片段的系统进化分析。结果　发现在ZJ0 1株的 93 91、 175 5 5、2 1712、 2 2 2 13和 2 7819位点 ,分别是T、T、G、T和T核苷酸碱基 ,和GenBank数据库中的其他SARS冠状病毒株比较 ,除第 1、 2、 4和 5突变位点 (C :G :C :C/T :T :T :T)之外 ,发现在 2 1712位点 (第 3个 )A/G突变也参于这一遗传标识。因此我们提出 5个突位点将 17株病毒分为两种基因型的新概念 ,即C :G :A :C :C与T :T :G :T :T两型 ,简称C型和T型。ZJ0 1病毒株属于T基因型 ,在中国大陆内地是首次发现和发表。突起蛋白基因片断的进化树分析 ,广州的GZ0 1C基因型株进化距离和其他病毒株相差甚远 ;比较而言 ,和C基因型BJ0 1、CUHK W1病毒株较为接近 ,其次是T基因型的F1和F2组。 5个突变位点 (C :G :A :C :C/T :T :G :T :T)的两个发生在编码突起蛋白 (S)的基因中 ,分别是A/G和C/T突变 ,由此引起的突起蛋白 (S)氨基酸变化是Asp/

关 键 词：SARS  冠状病毒 严重急性呼吸综合症 传染性非典型肺炎 基因多态性  基因突变  CT 基因型

分 类 号：R563.1]