期刊文章详细信息
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]浙江大学沃森基因组科学研究院,杭州310008 [2]温州师范学院生命与环境科学学院,温州325027
基 金:科学技术部"863"国际合作项目(批准号:2002AA229061);中国科学院知识创新重大项目(批准号:KSCX1-01)资助
年 份:2005
卷 号:35
期 号:5
起止页码:462-471
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2004、CSCD、CSCD2011_2012、核心刊
摘 要:构建了不同猪种、不同发育时期的非标准化家猪乳腺cDNA文库,并从中获得28941条高质量ESTs(expressed sequence tags).利用序列拼接软件CAP3,这些EST序列被拼接成2212条重叠群和5642条单一序列.这些序列在经过功能注释后被聚类成6857个基因聚类,其中2072条无相应功能注释的序列被认为来自于新基因.按照标准基因词汇体系的分类标准,已经有功能注释的基因进行了聚类分析.通过比较基因表达谱,确定了几组在猪种间和猪种内不同发育时期乳腺中差异表达的基因,这些基因中某些可能与家猪的繁殖特性相关,另外则在乳汁合成、分泌和乳腺复旧过程中发挥重要的作用.这些来源于家猪乳腺特定发育时期的基因表达谱和一些功能未知的EST序列为进一步的研究提供了重要资源.
关 键 词:表达序列标签 表达谱 家猪 乳腺 差异表达基因 基因表达谱 发育时期 猪种 构建 EST序列
分 类 号:S828]
参考文献:
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引证文献:
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同被引文献:
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