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研究主题:生物信息分析    测序    生物信息    丰度    宏基因组    

研究学科:自动化类    轻工类    生物科学类    

被引量:21H指数:3WOS: 1 EI: 2 北大核心: 5 CSCD: 5

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94 条 记 录,以下是 1-10

一种适用于批量筛选和鉴定拟南芥突变体的快速DNA提取方法
1
《云南大学学报(自然科学版)》中国科学院昆明植物研究所西南野生生物种质资源库;中国科学院大学;深圳华大基因科技服务有限公司;广州基迪奥生物科技有限公司 张小明 勾雪娇 梁鹏 林华明 赵晋洁 胡向阳  出版年:2015
国家自然科学基金(31470348)
DNA提取是拟南芥突变体筛选与鉴定中的关键环节.结合拟南芥突变体鉴定特点和DNA提取特点,对传统SDS法进行改良,摸索出一种简易、快速且经济的DNA提取方法,并将其应用到突变体的批量筛选与鉴定中.使用该方法可在常温下利用...
关键词:拟南芥 DNA提取 SDS抽提法  聚合酶链式反应 突变体鉴定  三引物法  
基于基因组学分析嗜热链球菌KLDS SM的蛋白质水解系统和氨基酸合成途径 ( EI收录)
2
《食品科学》东北农业大学乳品科学教育部重点实验室;广州基迪奥生物科技有限公司 李柏良 丁秀云 靳妲 刘飞 蒙月月 李娜 赵莉 霍贵成  出版年:2018
"十三五"国家重点研发计划重点专项(2017YFD0400303);国家自然科学基金青年科学基金项目(31401512)
为从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM蛋白质水解和氨基酸合成的能力,首先基于Illumina Hiseq 2500与Pacbio RSII测序平台对嗜热链球菌KLDS SM进行全基因组测序并绘制基因组图谱;随后从胞外...
关键词:嗜热链球菌 基因组 生物信息分析 蛋白质水解 氨基酸合成  
嗜热链球菌KLDS3.1012胞外多糖合成途径的基因组学及表型特征分析 ( EI收录)
3
《食品科学》东北农业大学乳品科学教育部重点实验室;广州基迪奥生物科技有限公司 李柏良 赵莉 王成凤 靳妲 丁秀云 刘飞 霍贵成  出版年:2019
"十三五"国家重点研发计划重点专项(2017YFD0400303);国家自然科学基金青年科学基金项目(31401512)
在分子水平上挖掘嗜热链球菌KLDS3.1012合成胞外多糖的途径并且通过表型特征进行验证。首先,基于Illumina HiSeq与Illumina MiSeq测序平台对菌株KLDS3.1012进行基因组测序并构建基因组图...
关键词:嗜热链球菌 基因组测序 生物信息分析 糖代谢 胞外多糖
灵武长枣贮藏过程中细胞壁成分及其相关酶活性的变化
4
《食品与发酵工业》宁夏大学食品与葡萄酒学院;广州基迪奥生物科技有限公司 杨静慧 邱雪 张海红 郝慧慧  出版年:2022
国家自然科学基金(31860422)。
为了解析贮藏过程中鲜食灵武长枣硬度变化的微观机理,该文利用原子力显微镜对长枣细胞壁多糖纳米结构的降解规律进行了研究,并对其降解酶活性、水分含量与果实硬度进行了相关分析。结果表明,前8 d为果实快速软化期,液泡水水分含量A...
关键词:灵武长枣 硬度  原子力显微镜 细胞壁降解酶 螯合性果胶  
重金属胁迫下白骨壤数字基因表达谱分析
5
《林业科学研究》岭南师范学院生命科学与技术学院;广州基迪奥生物科技有限公司 袁长春 莫健新 袁柳娇 余如凤 刘倩 钟军弟 刘锴栋  出版年:2017
广东省林业科技创新项目(2013KJCX011-03;2015KJCX025);国家级大学生创新创业训练计划项目(201510579277);湛江市热带特色资源植物技术开发重点实验室项目(2014A06008);岭南师范学院自然科学研究项目(LZL1507)
[目的]从转录组水平研究重金属污水胁迫处理下白骨壤的基因表达变化,以揭示白骨壤响应重金属污染胁迫的机制。[方法]采用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术对重金属污水胁迫处理组和对照组白骨壤材料进行转录组测序分析。...
关键词:白骨壤 重金属胁迫 数字基因表达谱(DEG)  差异表达基因 机制  
三七根部总RNA不同提取方法的比较
6
《贵州农业科学》揭阳职业技术学院实训中心;广州基迪奥生物科技有限公司;揭阳职业技术学院生物工程系 郑锐东 姚啟聪 廖鹏 吴漫晔  出版年:2015
为探明三七根部总RNA的最佳提取方法,获取高质量RNA,选取三七根部为材料,比较Trizol试剂法、CTAB法、改良Trizol法和试剂盒法提取三七根部总RNA的质量。结果表明:4种方法提取三七根部RNA效果不同,其中以...
关键词:三七根部  RNA提取 改良Trizol法  
单细胞t-SNE图前端可视化方法、装置、设备及介质
7
[发明专利] 广州基迪奥生物科技有限公司 20221026周煌凯 高川 艾鹏 张从曦 孙鹏鹏  出版年:2023
本发明实施例公开了一种单细胞t‑SNE图前端可视化方法、装置、设备及介质,涉及生物信息技术领域,该方法包括:S1,接收输入文件并确定细胞点总数量,在细胞点总数量大于第一预设阈值时,执行步骤S2,反之,执行步骤S5;S2,...
一种空间转录组测序数据的分析方法
8
[发明专利] 广州基迪奥生物科技有限公司 20201221周煌凯 高川 陈飞钦 艾鹏 张秋雪  出版年:2021
本发明属于生物技术和生物信息技术领域,具体涉及一种空间转录组测序数据的分析方法。本发明提供的测序数据的分析方法,主要包括样本检测建库和测序数据生物信息分析等过程。本发明提供了全面、系统的空间转录组测序建库和数据生物信息分...
一种基于云计算的RNA-seq在线报告流程分析方法及系统
9
[发明专利] 广州基迪奥生物科技有限公司 20191128周煌凯 夏昊强 高川 张羽 陶勇 罗玥 曾川川  出版年:2020
本发明公开了一种基于云计算的RNA‑seq在线报告流程分析方法及系统,该方法包括:步骤S1,提供用户上传数据的操作;步骤S2,根据用户数据上传的操作自动链接从云服务器中获取用户上传的对应项目的测序原始数据,并提供用户设置...
一种单细胞ATAC-seq数据分析方法
10
[发明专利] 广州基迪奥生物科技有限公司 20190820夏昊强 高川 周煌凯 张羽 陶勇 罗玥 陈飞钦 曾川川  出版年:2019
本发明提供一种单细胞ATAC‑seq数据分析方法,包括以下步骤:步骤S1,对测序原始数据进行数据分析与质控;步骤S2,比对分析;步骤S3,插入片段分析;步骤S4,富集区域Peak分析;步骤S5,单细胞亚群分类;步骤S6,...
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