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专利详细信息

单细胞t-SNE图前端可视化方法、装置、设备及介质       

文献类型:专利

专利类型:发明专利

是否失效:

是否授权:

申 请 号:CN202211318289.2

申 请 日:20221026

发 明 人:周煌凯 高川 艾鹏 张从曦 孙鹏鹏

申 请 人:广州基迪奥生物科技有限公司

申请人地址:510005 广东省广州市黄埔区国际生物岛螺旋三路12号第七层703单元

公 开 日:20230203

公 开 号:CN115691681A

代 理 人:代春兰

代理机构:广州华享智信知识产权代理事务所(普通合伙)

语  种:中文

摘  要:本发明实施例公开了一种单细胞t‑SNE图前端可视化方法、装置、设备及介质,涉及生物信息技术领域,该方法包括:S1,接收输入文件并确定细胞点总数量,在细胞点总数量大于第一预设阈值时,执行步骤S2,反之,执行步骤S5;S2,根据每个细胞亚群的细胞点数量以及第一预设条件对细胞亚群进行筛选,形成第一细胞亚群集合和第二细胞亚群集合;S3,设置基础细胞点数量,对第一细胞亚群集合中每个细胞亚群的细胞点进行合并;S4,确定目标细胞点数量,如果目标细胞点数量大于第一预设阈值,则重复执行步骤S2‑S3;S5,使用Canvas进行图形绘制。本发明实施例可以缩短图形渲染的时间,提高了使用者的使用体验。

主 权 项:1.一种单细胞t-SNE图前端可视化方法,其特征在于,其包括以下步骤:S1,接收输入文件并确定细胞点总数量,所述细胞点总数量为整张待渲染图中所有的细胞点数量,在所述细胞点总数量大于第一预设阈值时,执行步骤S2,反之,执行步骤S5;S2,根据每个细胞亚群的细胞点数量以及第一预设条件对所述细胞亚群进行筛选,形成第一细胞亚群集合和第二细胞亚群集合,其中,所述第一细胞亚群集合为细胞点数量满足第一预设条件的所有细胞亚群的集合,所述第一细胞亚群集合为细胞点数量不满足第一预设条件的所有细胞亚群的集合,所述第一预设条件为细胞点数量大于第二预设阈值,或/和,细胞点数量大于所有细胞亚群的细胞点数量的中位数;S3,设置基础细胞点数量,对所述第一细胞亚群集合中每个细胞亚群的细胞点进行合并;S4,确定目标细胞点数量,所述目标细胞点包括第二细胞亚群集合中的所有细胞点以及第一细胞亚群集合中经过合并处理后的所有细胞点,如果所述目标细胞点数量大于第一预设阈值,则重复执行步骤S2-S3直至目标细胞点数量小于或等于第一预设阈值;S5,构建目标细胞点的坐标信息,使用Canvas进行图形绘制。

关 键 词:细胞亚群 细胞 集合  目标细胞  预设  生物信息技术 基础细胞  接收输入  图形绘制 图形渲染 预设条件  重复执行  可视化 阈值时  筛选  合并  

IPC专利分类号:G16B45/00;G16B5/00

参考文献:

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二级参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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二级引证文献:

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同被引文献:

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