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北京大学前沿交叉学科研究院定量生物学中心 收藏

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研究主题:抑制剂    TSR    LIGAND    GENE_EXPRESSION    AFFECTS    

研究学科:生物科学类    自动化类    

被引量:30H指数:3WOS: 1 EI: 1 北大核心: 2 CSCD: 4

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16 条 记 录,以下是 1-10

大数据时代的药物设计与药物信息 ( EI收录)
1
《科学通报》北京大学前沿交叉学科研究院定量生物学中心;北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室 孙潭霖 裴剑锋  出版年:2015
国家高技术研究发展计划(2012AA020301);天然药物及仿生药物国家重点实验室开放基金资助
大数据时代,以数据驱动的药物研发(data-driven drug research and development)方式有望显著提高药物研发成功率、缩短药物研发周期以及降低药物研发成本.本文简短综述了近年来药物设计和药...
关键词:大数据 药物设计 药物信息 语义网络 深度学习  
冠状病毒3CL蛋白酶活性调控机制及抑制剂研究
2
《中国科学:化学》北京大学化学与分子工程学院;北京大学前沿交叉学科研究院定量生物学中心;北京大学-清华大学生命科学联合中心 李春梅 孙琦 陆阳彬 刘莹 来鲁华  出版年:2020
国家重点研发计划(编号:2016YFA0502303);国家自然科学基金(编号:21633001)资助项目。
由冠状病毒感染引发的全球性疫情对人类健康造成了巨大威胁,时至今日尚未有特效的治疗药物或疫苗问世,因此开发具有临床应用价值的抗冠状病毒药物刻不容缓. 3CL蛋白酶在冠状病毒的复制过程中起关键作用,其序列具有高度保守性,是进...
关键词:新型冠状病毒肺炎  冠状病毒 3CL蛋白酶  抑制剂 药物研发
深度学习在化学信息学中的应用
3
《大数据》北京大学前沿交叉学科研究院定量生物学中心 徐优俊 裴剑锋  出版年:2017
国家自然科学基金资助项目(No.21673010)~~
深度学习在计算机视觉、语音识别和自然语言处理三大领域中取得了巨大的成功,带动了人工智能的快速发展。将深度学习的关键技术应用于化学信息学,能够加快实现化学信息处理的人工智能化。化合物结构与性质的定量关系研究是化学信息学的主...
关键词:深度学习  人工智能 定量构效关系 化学信息学
DNA数字信息存储:造梦、追梦与圆梦
4
《合成生物学》北京大学前沿交叉学科研究院定量生物学中心;深圳华大生命科学研究院;广东省高通量基因组测序与合成编辑应用重点实验室;天津大学;天津大学教育部“珠峰计划”合成生物学前沿科学中心;天津大学系统生物工程教育部重点实验室;中国科学院;中国科学院大学;中国医学科学院;华大基因;发展中国家科学院(TWAS);美国国家科学院;德国国家科学院;丹麦皇家科学院 钱珑 沈玥 元英进 欧阳颀 杨焕明  出版年:2021
生物体具有精妙绝伦的信息系统。2010年,美国J.Craig Venter研究院将化学合成的约1 Mb的基因组DNA导入受体细菌,成功启动了世界首个“人造生命”辛西娅。这条基因组携带有46位科学家的姓名和一个专属邮箱地址...
关键词:遗传密码 人造生命 碱基序列  高级研究计划局  合成生物学 美国国家标准 DNA 数字信息
基于靶标结构的环肽分子计算设计
5
《合成生物学》北京大学前沿交叉学科研究院定量生物学中心;北京大学化学与分子工程学院;北京大学-清华大学生命科学联合中心 王凡灏 来鲁华 张长胜  出版年:2023
国家自然科学基金(21977007)。
环肽在调控蛋白质-蛋白质相互作用方面具有独特的优势,在新药研发领域受到了越来越多的关注。蛋白质相互作用界面一般较大而平坦,相较于小分子化合物,环肽分子更容易获得与这些靶标位点结合的高亲和力和高特异性。相较于线性多肽或蛋白...
关键词:环肽 多肽药物 多肽设计  构象生成  
How ligand-receptor binding kinetics affects downstream gene expression
6
中国生物化学与分子生物学会第十二届全国会员代表大会暨2018年全国学术会议 2018郭安南 张晓玲 来鲁华  出版年:2018
近年来研究表明,配体受体结合动力学在信号通路功能选择性方面发挥重要作用。NF-κB控制着下游与炎症、免疫应答、细胞增殖分化等生理功能相关的数百个基因的表达,其活性的错误调控将引起多种疾病。不同的TNFα-TNFR1结合动...
关键词:功能选择性  结合动力学  基因表达谱
大肠杆菌趋化性受体Tsr的趋化性分子筛选与负趋分子机制研究
7
中国生物化学与分子生物学会2016年全国学术会议 2016陈曦 马晓旻 毕双玉 来鲁华  出版年:2016
<正>细菌能够感受周围环境中化合物,并沿着化合物的浓度梯度定向运动,这种性质称为趋化性。细菌朝着化合物高浓度的方向运动,称为正趋,该化合物就是引诱剂,反之是负趋,该化合物就是驱散剂。细菌趋化性是通过其细胞膜上的趋化性受体...
关键词:趋化性 受体  引诱剂 驱散剂  分子机制
基于深度学习的自动逆合成反应路线预测
8
2019中国化学会第十五届全国计算(机)化学学术会议 2019林康杰 徐优俊 裴剑峰 来鲁华  出版年:2019
自从E. J. Corey提出逆合成分析,利用计算机来辅助合成路线设计一直是有机化学家的愿景。现有的大多数的方法都是基于反应规则模板来预测合成路线,主要分为两种,分别是专家手写规则和自动反应规则提取。但是,手写反应规则耗...
关键词:逆合成路线预测  深度学习  机器翻译模型  seq2seq  蒙特卡洛树搜索  
大肠杆菌趋化性受体Tsr的趋化性分子筛选与分子机制研究
9
中国化学会第29届学术年会 2014陈曦 马晓旻 来鲁华  出版年:2014
细菌能够感受周围环境中化合物,并沿着化合物的浓度梯度定向运动,这种性质称为趋化性。细菌朝着化合物高浓度的方向运动,称为正趋,该化合物就是引诱剂,反之是负趋,该化合物就是驱散剂。细菌趋化性是通过其细胞膜上的趋化性受体及其下...
关键词:趋化性 受体  引诱剂 驱散剂  分子机制
靶向毒素蛋白HipA的抑制剂能够减轻细菌的多药耐药性
10
中国化学会第30届学术年会 2016裴剑锋 李佟清 来鲁华  出版年:2016
持留菌是细菌群体中一小部分没有发生基因突变,但是对多种抗生素耐药的群体,是导致抗菌治疗失败和细菌多药耐药性产生的主要原因之一。持留菌的产生与毒素-抗毒素系统具有较强的关联性。
关键词:持留菌  毒素-抗毒素模块  HipA  
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