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哈尔滨医科大学生物信息学系 收藏

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研究主题:基因表达谱    基因功能    ONTOLOGY    特征基因    GENE    

研究学科:生物科学类    自动化类    

被引量:100H指数:6WOS: 8 EI: 5 北大核心: 32 CSCD: 33

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55 条 记 录,以下是 1-10

安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究
1
《中国神经精神疾病杂志》哈尔滨医科大学生物信息学系;成都康弘集团博士后工作站 钟国才 李强 柯尊洪 吕莹丽 郝晓峰 李崇前 杨达 王海敏 王栋 郭政  出版年:2007
国家自然科学基金资助项目(编号:30170515;30370388;30370798;30570424;30571034);国家863计划资助项目(编号:2003AA2Z2051;2002AA2Z2052);黑龙江科技攻关重点资助项目(编号:GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关资助项目(编号:2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金资助项目(编号:F0177);哈医大211工程"十五"建设项目资助
目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,...
关键词:安佳欣胶囊  抑郁症 基因表达谱 GENE ONTOLOGY 基因功能
结合蛋白质互作与基因表达谱信息大范围预测蛋白质的精细功能
2
《中国科学(C辑)》哈尔滨医科大学生物信息学系 高磊 李霞 郭政 朱明珠 李彦辉 饶绍奇  出版年:2006
国家自然科学基金(批准号:30170515;30370388;30370798;30570424和30571034);国家863计划(批准号:2003AA2Z2051和2002AA2Z2052);黑龙江科技攻关重点(批准号:GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关(批准号:2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金(批准号:F0177);黑龙江省教育厅杰出海外学人基金(批准号:1055HG009)
GESTs(gene expression similarity and taxonomy similarity)是结合基因表达相似性和基因功能分类体系Gene Ontology(GO)中的功能概念相似性测度进行功能预测...
关键词:基因表达谱 蛋白质互作  GENE ONTOLOGY 相似·性距离  蛋白质功能 预测  
强迫症与5-羟色胺候选基因的关联研究
3
《中国行为医学科学》哈尔滨医科大学精神卫生研究所;哈尔滨医科大学医学心理学教研室;哈尔滨医科大学生物信息系;哈尔滨香坊区朝阳医院 刘薇 曹金霞 郭烽炜 宫滨生 李晋 陈力 胡建  出版年:2007
黑龙江省卫生厅基金资助项目(2005K-142)
目的探讨北方汉族人群中5-HT2A、5-HT2C、5-HT1Dβ受体基因与强迫症的关系。方法采用聚合酶链反应扩增片段长度多态技术测定103个强迫症的核心家系的5-HT2A-1438G/A、5-HT2C Cey23Ser、...
关键词:强迫症 基因 5-羟色胺2A受体 5-羟色胺2C受体  5-羟色胺1Dβ受体  
毒蕈乙酰胆碱受体亚型关系的研究
4
《遗传》哈尔滨医科大学生物信息学系;黑龙江省生物医药重点实验室 于海龙 肖云 艾静 李霞 宫滨生  出版年:2007
国家自然科学基金(编号:30170515;30571034;30570424;30600367);国家高技术研究发展计划项目(863计划)(编号:2003AA2Z2051);黑龙江科技攻关(编号:GB03C602-4);黑龙江自然科学基金(编号:F2004-02);哈尔滨医科大学青年科学基金(编号:060045)项目资助~~
利用不同类型的生物学数据,运用生物信息学方法和策略,从分子进化、序列相似性、表达相关性以及蛋白互作4个层面对M受体亚型之间的关系进行了比较全面的研究。分析表明,从分子进化和序列相似性角度,毒蕈乙酰胆碱受体5种亚型可分为2...
关键词:毒蕈乙酰胆碱受体  亚型  分子进化 表达相关性  蛋白质互作  
血管内皮生长因子受体3和Podoplanin在人结肠癌组织中的表达
5
《解剖学杂志》哈尔滨医科大学解剖学教研室;哈尔滨医科大学生物信息学系 刘宝全 张雅芳 宿菲 马晶 李雪梅 杨树才  出版年:2007
黑龙江省自然科学基金(D0235)
目的:观察血管内皮生长因子受体3(vascular endothelial growth factor receptor-3,VEGFR-3)和Podoplanin在人结肠癌组织中的表达,以探讨二者标记淋巴管的特异性。方...
关键词:结肠肿瘤 血管内皮生长因子受体3 PODOPLANIN
GO功能类与基因差异表达的关联规则挖掘算法 ( SCI收录)
6
《生物化学与生物物理进展》哈尔滨医科大学生物信息系 屠康 喻辉 郭政 李霞  出版年:2004
国家自然科学基金资助项目 ( 3 9970 3 97;3 0 170 5 15 );国家高技术"863"计划资助项目 ( 2 0 0 2AA2 2 2 0 5 2 ;2 0 0 3AA2Z2 0 5 1);黑龙江科技攻关重点项目 (GB0 3C60 2 4);哈尔滨市科技攻关项目( 2 0 0 3AA3CS113 );黑龙江自然科学基金资助项目 (F0 1
针对基因功能分类体系GeneOntology的层次结构特点 ,修改关联规则挖掘算法Apriori,开发“挖掘与基因差异表达关联的GO功能组合”软件 (RuleGO) .RuleGO以基因表达谱上的差异表达基因集合和不差异...
关键词:基因表达谱 差异表达  关联规则 Gene  ONTOLOGY 基因芯片技术
调控通路内基因表达的相关性分析
7
《遗传》哈尔滨医科大学生物信息学系 李传星 李霞 郭政 宫滨生 屠康  出版年:2004
国家自然科学基金 ( 3 0 170 5 15 ;3 0 3 70 798) ;国家 863计划 ( 2 0 0 3AA2Z2 0 5 1;2 0 0 2AA2Z2 0 5 2 ) ;黑龙江科技攻关重点项目 (GB0 3C60 2 ) ;黑龙江自然科学基金 (F0 177) ;2 11工程"十五"建设项目~~
从基因表达调控通路的角度分析了基因功能与基因表达之间的关系 ,利用 7套酿酒酵母基因芯片表达谱数据和通路数据库 (KEGG和CYGD)所提供的信息 ,应用我们研制的Genehub软件分析研究了同一基因表达调控通路内的基因...
关键词:调控通路 基因芯片 相似性测度  酿酒酵母
利用基因表达谱挖掘差异表达功能类的稳健性
8
《生物信息学》哈尔滨医科大学生物信息学系 颜兴起 郭政 李霞 王栋 屠康  出版年:2006
国家自然科学基金(30370798;30170515;30370388);国家863计划(2003AA2Z20512002AA2Z2052);黑龙江科技攻关重点项目(GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关项目(2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金(F0177);哈医大211工程"十五"建设项目
Gene Ontology广泛地应用于基于基因芯片数据的差异表达功能类分析。基因芯片技术存在检测缺失与检测误差等问题。本文探讨上述这二个因素对利用基因表达谱挖掘Gene Ontology中差异表达功能类的影响。结果显示,...
关键词:基因芯片 稳健性 Gere  ONTOLOGY
基因功能预测问题中的样本不平衡处理
9
《中国生物医学工程学报》哈尔滨医科大学生物信息学系 朱明珠 郭政 李霞 刘帅 李彦辉 高磊  出版年:2006
国家自然科学基金资助项目(39970397;30170515;30370388);国家"863"计划(2002AA2Z2052;2003AA2Z2051);黑龙江科技攻关重点(GB03C6024);黑龙江自然科学基金资助项目(F0177);哈尔滨市科技攻关(2003AA3CS113);哈尔滨医科大学211工程"十五"建设项目
应用机器学习进行分类是基因功能预测的一种重要手段。但是许多预测集中的阳性样本过少,会降低功能预测的效果。针对此问题,本研究对结合支持向量机(SVM)算法的几种常用非平衡数据分类方法进行实验比较,包括投票整合分类器和移动分...
关键词:支持向量机 功能预测  基因表达谱 不平衡
结合基因功能分类体系筛选聚类特征基因
10
《生物物理学报》哈尔滨医科大学生物信息学系 徐建震 郭政 李霞 李永进 刘帅 屠康  出版年:2005
国家自然科学基金项目(30370798;30170515;30370388);国家863计划课题(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052);黑龙江科技攻关重点项目(GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关项目(2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金项目(F0177);哈医大211工程"十五"建设项目
使用两套基因表达谱数据,按各基因的表达值方差,选择表达变异基因对样本聚类,发现一般使用方差较大的前10%的基因作为特征基因,就可以较好地对疾病样本聚类。对不同的疾病,包含聚类信息的特征基因有不同的分布特点。在此基础上,结...
关键词:基因表达谱 聚类 特征选择  结合基因功能分类体系Gene  ONTOLOGY
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