文献类型：期刊文章

作　　者：屠康[1] 喻辉[1] 郭政[1] 李霞[1]

机构地区：[1]哈尔滨医科大学生物信息系,哈尔滨150086

出　　处：《生物化学与生物物理进展》

基　　金：国家自然科学基金资助项目 ( 3 9970 3 97;3 0 170 5 15 );国家高技术"863"计划资助项目 ( 2 0 0 2AA2 2 2 0 5 2 ;2 0 0 3AA2Z2 0 5 1);黑龙江科技攻关重点项目 (GB0 3C60 2 4);哈尔滨市科技攻关项目( 2 0 0 3AA3CS113 );黑龙江自然科学基金资助项目 (F0 1

年　　份：2004

卷　　号：31

期　　号：8

起止页码：705-711

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCI(收录号：WOS:000223647600007)、SCI-EXPANDED(收录号：WOS:000223647600007)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：针对基因功能分类体系GeneOntology的层次结构特点 ,修改关联规则挖掘算法Apriori,开发“挖掘与基因差异表达关联的GO功能组合”软件 (RuleGO) .RuleGO以基因表达谱上的差异表达基因集合和不差异表达基因集合为输入 ,输出组合特征功能类与基因差异表达现象的关联规则 ,有助于解释基因差异表达现象的本质原因 ,如疾病发病机制、药物作用机理等 .将RuleGO和OntoExpress应用在结肠癌和腺癌表达谱数据集上 ,结果显示 ,RuleGO比OntoExpress能发现更多的与差异表达现象关联的特征功能类 ,更能看到在OntoExpress上不能发现的组合特征功能类 .另外 ,结果显示 ,将规则的置信度和支持度要求设置较高时 ,一般只有组合功能类才能满足要求 ,这提示在基因表达谱分析中不宜采用单个角度的单个功能分类单元 。

关 键 词：基因表达谱 差异表达  关联规则 Gene  ONTOLOGY 基因芯片技术

分 类 号：Q617] Q75