文献类型：期刊文章

作　　者：徐建震[1] 郭政[1] 李霞[1] 李永进[1] 刘帅[1] 屠康[1]

机构地区：[1]哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨150086

出　　处：《生物物理学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(30370798;30170515;30370388);国家863计划课题(2003AA2Z2051;2002AA2Z2052);黑龙江科技攻关重点项目(GB03C602-4);哈尔滨市科技攻关项目(2003AA3CS113);黑龙江自然科学基金项目(F0177);哈医大211工程"十五"建设项目

年　　份：2005

卷　　号：21

期　　号：3

起止页码：187-194

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2004、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：使用两套基因表达谱数据,按各基因的表达值方差,选择表达变异基因对样本聚类,发现一般使用方差较大的前10%的基因作为特征基因,就可以较好地对疾病样本聚类。对不同的疾病,包含聚类信息的特征基因有不同的分布特点。在此基础上,结合基因功能分类体系(Gene Ontology,GO),进一步筛选聚类的特征基因。通过检验在Gene Ontology中的每个功能类中的表达变异基因是否非随机地聚集,寻找疾病相关功能类,再根据相关功能类中的表达变异基因进行聚类分析。实验结果显示:结合基因功能体系进一步筛选表达变异基因作为聚类特征基因,可以保持或提高聚类准确性,并使得聚类结果具有明确的生物学意义。另外,发现了一些可能和淋巴瘤和白血病相关的基因。

关 键 词：基因表达谱 聚类 特征选择  结合基因功能分类体系Gene  ONTOLOGY

分 类 号：Q61]