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调控通路内基因表达的相关性分析
Analysis of the mRNA Expression Similarity of Genes in the Same Gene Expression Regulatory Pathway
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨150086
基 金:国家自然科学基金 ( 3 0 170 5 15 ;3 0 3 70 798) ;国家 863计划 ( 2 0 0 3AA2Z2 0 5 1;2 0 0 2AA2Z2 0 5 2 ) ;黑龙江科技攻关重点项目 (GB0 3C60 2 ) ;黑龙江自然科学基金 (F0 177) ;2 11工程"十五"建设项目~~
年 份:2004
卷 号:26
期 号:6
起止页码:929-933
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:从基因表达调控通路的角度分析了基因功能与基因表达之间的关系 ,利用 7套酿酒酵母基因芯片表达谱数据和通路数据库 (KEGG和CYGD)所提供的信息 ,应用我们研制的Genehub软件分析研究了同一基因表达调控通路内的基因在mRNA表达水平上的相关性 ,共涉及 16条通路 ,4 95个基因。通过Pearson相关系数和Spearman相关系数两种相似性测度的分析 ,发现有 94 % (15条 )的基因表达调控通路内的基因在大于等于 4套的表达谱数据中是共表达的 ,以上结果从基因表达调控通路的角度 。
关 键 词:调控通路 基因芯片 相似性测度 酿酒酵母
分 类 号:TP399]
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