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全基因组关联分析研究进展: 1; 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所段忠取朱军出版年：2015; 国家自然科学基金面上项目"作物育种群体基因定位及分子选择育种新方法的研究"(31371250); 全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是近年来兴起的遗传分析方法,在人类和动植物复杂性状遗传研究中已取得初步成果。本文论述了GWAS研究的基本原理、主要分析方法及常用软件...; 关键词：全基因组关联分析复杂性状单核苷酸多态性关联位点

水稻全基因组R基因鉴定及候选RGA标记开发 ( EI收录): 2; 《科学通报》浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所;福建农林大学作物科学学院;福建农林大学作物科学学院汪旭升吴为人金谷雷朱军出版年：2005; 国家高技术研究发展计划(批准号:2003AA207160,2002AA234031);福建省自然科学基金(批准号:B9910011)资助项目; 用45个已知功能的植物抗病(R)基因序列对粳稻全基因组序列进行搜索, 共找出2119个R基因同源序列或类似物(RGA), 表明RGA在水稻基因组中成簇存在, 呈非随机分布. 采用隐马尔柯夫模型(HMM), 将这些RGA按...; 关键词：RGA 标记基因鉴定开发隐马尔柯夫模型全基因组序列水稻基因组非随机分布 index 亚种间植物抗病同源序列非编码区行搜索序列对类似物 R基因功能域多态性 PCR 共显性粳稻长度行比籼稻

Influence of Epistasis and QTL×Environment Interaction on Heading Date of Rice(Oryza sativa L.) ( SCI收录): 3; 《Journal of Genetics and Genomics》浙江大学农业与生物技术学院;华南农业大学农学院刘桂富杨剑徐海明朱军出版年：2007; QTLs for heading date of rice （Oryza sativa L.） with additive, epistatic, and QTL × environment （QE） interacti...; 关键词：quantitative trait locus （QTL） EPISTASIS QTL ×environment interaction heading date rice （Oryza sativa L.）

烟草核心种质库构建及遗传多样性研究(英文): 4; 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所;贵州烟草科学研究院;浙江大学空气污染与健康研究中心周佳萍杨春元吴春王仁刚史跃伟谢升东王志红徐海明任学良出版年：2014; Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31271608); 为有效地研究烟草遗传多样性和筛选潜在的繁殖材料,以贵州省烟草科学研究院805份烟草种质为实验材料,分别在贵州省金沙和福泉2个试验点进行多点田间试验,并采用混合线性模型预测12个农艺性状的基因型效应值,以构建烟草的核心种质...; 关键词：烟草遗传多样性核心种质基因与环境互作

家蚕基因组的snoRNA(Box C／D)的生物信息学分析与研究: 5; 中国细胞生物学学会医学细胞生物学学术大会 2006余东亮汪旭升徐飞傅衍出版年：2006; 真核生物中snoRNA大致可分为Box C／D和BoxH／ACA两大类,分别指导rRNA前体的甲基化和假尿苷酸化修饰。本文采用生物信息学的方法,对家蚕基因组中的Box C／D snoRNA进行预测和分析,共获到了70个s...; 关键词：家蚕 Box C／D snoRNA 甲基化计算机预测非编码RNA

基于四交群体的连锁图谱构建(英文): 6; 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所;云南省烟草农业科学研究院;阿拉巴马大学伯明翰分校生物统计系;浙江大学空气污染与健康研究中心蒋蓓蓓余世洲肖炳光楼向阳徐海明出版年：2014; Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31271608);the Yunnan Provincial Tobacco Company Project(No.08A05);the CNTC Science and Technology Project(No.110200701023);the National Institutes of Health(No.DA025095); 目前,遗传连锁图谱构建主要基于两纯系亲本交配的衍生群体,存在遗传多样性不足等局限,不适合于烟草等基因组多样性较低的物种,因为往往没有足够的多态性标记可用于图谱的构图,稀疏的标记图谱很难有效用于标记辅助选择及基因定位.本研...; 关键词：四交群体遗传距离遗传图谱连锁分析蒙特卡洛模拟

通过多基因组比较的方法在5种绿球蓝细菌中识别基因组岛(英文): 7; 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》浙江大学农业与生物技术学院生物信息研究所;四川农业大学农学院玉米研究所刘海岚朱军出版年：2010; Project supported by the National High Technology Research and Development Program of China(No.2006AA10A102);U.S.National Science Foundation(No.DBI-0516378); 为探索水平基因转移在绿球蓝细菌基因组多样性中的作用,5个高光适应性绿球蓝细菌基因组被比较.先用BLASTP两两最佳匹配搜索和基因位置保守性的方法预测直系同源基因,并进一步计算每个基因组中所有基因在其他4种绿球蓝细菌基因组...; 关键词：绿球蓝细菌基因组岛水平基因转移外源基因

家蚕基因组中SnoRNA(Box C/D)的生物信息学分析与研究: 8; 《中国农业科学》浙江大学沃森基因组科学研究院;浙江大学动物科学学院;浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所余东亮汪旭升徐飞傅衍出版年：2007; 国家重点基础研究发展计划"973"项目(2004CB117500); 【目的】探索生物信息方法在家蚕基因组snoRNA预测中的应用,了解snoRNA在家蚕基因组的分布和结构特征。【方法】利用已有和自行设计的生物信息工具对家蚕基因组中BoxC/DsnoRNA进行预测和手工校正。【结果】获到家...; 关键词：家蚕(Bombyx mori) BOX C/D SNORNA 甲基化计算机预测非编码RNA

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