文献类型：会议

作　　者：余东亮 汪旭升 徐飞 傅衍

作者单位：浙江大学沃森基因组科学研究院 浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所

会议文献：中国细胞生物学学会医学细胞生物学学术大会论文集

会议名称：中国细胞生物学学会医学细胞生物学学术大会

会议日期：20060500

会议地点：中国浙江杭州

主办单位：中国细胞生物学会医学细胞生物学专业委员会;浙江省细胞生物学学会;福建省细胞生物学学会

出版日期：20060500

学会名称：中国细胞生物学学会

语　　种：中文

摘　　要：真核生物中snoRNA大致可分为Box C／D和BoxH／ACA两大类,分别指导rRNA前体的甲基化和假尿苷酸化修饰。本文采用生物信息学的方法,对家蚕基因组中的Box C／D snoRNA进行预测和分析,共获到了70个snoRNA 和56个推测的甲基化位点。 snoRNA的结构分析发现D’box和末端茎环结构的不保守性。分析snoRNA在基因组上的分布,未发现普遍的成簇分布的现象, 且内含子和基因间隔区的snoRNA数目接近,研究同时表明分布于内含子区域的某些不含标准末端茎环结构的snoRNA或许可以借助其侧翼序列行使相似功能。本文对Box C／D snoRNA的指导序列作了相似性比较,发现指导序列相似的 snoRNA指导相同rRNA进行甲基化修饰。本研究预测的结果与己报道果蝇Box C／D snoRNA进行相似性分析,表明两个物种的Box C／D snoRNAs在一级结构上有较大的差异。研究利用计算方法首次系统地对家蚕基因组中的snoRNA进行了预测和分析,有助于家蚕基因组中snoRNA以及其他ncRNA的进一步研究。

关 键 词：家蚕 Box C／D snoRNA  甲基化 计算机预测  非编码RNA

分 类 号：Q953]