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上海生物信息技术研究中心 收藏

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研究主题:基因组DNA    提取基因组    引物    试剂盒    高灵敏度    

研究学科:自动化类    生物科学类    交通运输类    电子信息类    机械类    

被引量:334H指数:8WOS: 24 EI: 18 北大核心: 73 CSCD: 73

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209 条 记 录,以下是 1-10

生物医学大数据发展的新挑战与趋势
1
《中国科学院院刊》中国科学院计算生物学重点实验室生物医学大数据中心;上海生物信息技术研究中心 张国庆 李亦学 王泽峰 赵国屏  出版年:2018
国家重点研发计划精准医学专项(2017YFC0907505、2017YFC0908405、2016YFC0901904、2016YFC0901604); 中国科学院重点部署项目(ZD-SW-219)
生物医学数据从PB量级的组学时代进入到EB量级的多维度大数据时代,引发了生物医学研究向数据密集型的第四科学范式的深刻变革。如何将临床数据与研究数据进行高维度多层次的汇交共享,实现从"组学"到临床与健康人群数据的生物医学大...
关键词:生物医学 大数据 整合  交互  数据挖掘
应用复杂网络理论研究代谢网络的进展 ( EI收录)
2
《科学通报》上海交通大学生命科学技术学院;上海生物信息技术研究中心 赵静 俞鸿 骆建华 曹志伟 李亦学  出版年:2006
国家科技攻关计划(批准号:2004BA711A21);国家重点基础研究发展计划(批准号:2004CB720103);国家自然科学基金(编号:30500107);上海市科学技术委员会(批准号:04QMX1450,04DZ19850,04DZ14005)资助项目.
后基因组生物信息学研究的一个重要任务是系统地研究活细胞内所有分子和它们之间的相互作用,从而了解这些分子及它们之间的相互作用对整个生物体功能的影响.而网络则是对各种相互作用关系的恰当的抽象描述.近年来,复杂网络理论在揭示各...
关键词:生物信息学 系统生物学 代谢网络 网络结构 网络分解  网络稳健性  
电子健康档案标准——CDA与openEHR
3
《中国医疗设备》同济大学生命科学与技术学院;上海生物信息技术研究中心;中科院上海健康科学研究所 王婴 姚志洪 刘雷  出版年:2010
国家高技术研究发展计划(863)(2007AA02Z332;2006AA02Z344);浦江人才计划(08PJ14084)
电子健康档案记录个人终生完整、准确的健康信息。针对目前常见的医疗档案标准,本文针对HL7CDA与openEHR进行了详细阐述,并针对两者在适用范围、模型结构与安全性方面的不同进行比较。并针对中国电子健康档案发展的前景进行...
关键词:HL7 CDA openEHR  电子健康档案
基于语义路径覆盖的Gene Ontology术语间语义相似性度量方法
4
《自然科学进展》复旦大学计算机与信息技术系;上海生物信息技术研究中心;复旦大学生命科学学院 李荣 曹顺良 李园园 谭灏 朱扬勇 钟扬 李亦学  出版年:2006
国家"八六三"计划项目(2002AA231011);上海市科委重大项目(02DJ14013)资助
进行GO(gene ontology)语义相似性度量是解决生物学数据集成中语义异构问题的重要方法。传统方法主要是基于距离的度量和基于信息量的度量。文中提出了一种基于语义路径覆盖的度量方法,并实现了其中Combine算法。...
关键词:GENE ONTOLOGY 语义相似性度量  信息量  
Gene Ontology在生物数据整合中的应用 ( EI收录)
5
《计算机工程》复旦大学计算机与信息技术系;上海生物信息技术研究中心 夏燕 张忠平 曹顺良 朱扬勇 李亦学  出版年:2005
国家"863"计划基金资助项目(2002AA231011);上海市重大科技资助项目(02DJ14013)
异构数据的高效整合,在生物数据呈爆炸性增长、生物数据库复杂度不断增加的今天,具有重要的理论价值和实际意义。该文基于BioDW——一个整合的生物信息学数据仓库平台,利用统一的GeneOntology语义模型,建立异构数据库...
关键词:生物  整合问题  实际  检索  数据整合 层次  联系  异构数据库 语义模型 数据仓库
BioDW——一个生物信息学数据集成系统
6
《微计算机应用》复旦大学计算机与信息技术系;燕山大学计算机科学与工程系;上海生物信息技术研究中心 曹顺良 张忠平 李荣 朱扬勇 李亦学  出版年:2005
本工作为国家"863"高科技研究与发展计划资助项目(批准号:2002AA231011)上海市科学技术委员会重大攻关项目(批准号02DJ14013)。
异构的生物数据源的数据集成是现代生物学研究的前提和关键。根据生物信息学数据自身的特点,我们开发了一个生物信息学数据集成系-BioDW。本文介绍了BioDW的体系结构和实现BioDW的一些关键技术,即数据源之间的互操作、语...
关键词:DW 数据集成系统 数据源  刷新 异构  互操作 体系结构  生物信息学 性问题  现代生物学
靶向捕获测序技术检测川崎病冠状动脉损害易感基因研究
7
《中华儿科杂志》上海交通大学附属儿童医院上海市儿童医院心内科;上海生物信息技术研究中心 朱丹颖 宋思瑞 谢利剑 裘锋 杨竞 肖婷婷 黄敏  出版年:2017
上海市国际科技合作基金项目(15410722900);上海市市级医院新兴前沿技术联合攻关项目(SHDC12016119);国家高技术研究发展计划(863计划)(2015AA020105)
目的应用靶向捕获测序技术对川崎病患者进行基因定制芯片筛查,探讨川崎病及冠状动脉损害易感基因。方法采用病例对照的研究方法,选择2015年12月至2016年11月在上海市儿童医院就诊的川崎病患儿114例作为川崎病组和门诊健康...
关键词:黏膜皮肤淋巴结综合征 基因 儿童  
一种基于KKT条件和壳向量的SVM增量学习算法
8
《电子科技》上海理工大学光电信息与计算机工程学院;上海生物信息技术研究中心 茅嫣蕾 魏赟 贾佳  出版年:2016
国家自然科学基金资助项目(61170277);上海市教委科研创新基金资助项目(12YZ094)
针对传统支持向量机(SVM)增量算法,在学习过程中因基于局部最优解而可能舍弃含隐性信息的非支持向量样本,以及对于新增样本需全部进行训练的缺点,文中提出一种基于KKT条件和壳向量的SVM增量学习算法。该方法利用壳向量的特性...
关键词:SVM 增量学习  KKT条件 壳向量  
用mtDNA COⅡ基因序列确定我国北部湾红树植物白骨壤虫灾虫源
9
《自然科学进展》深圳市羊台山森林公园管理处;山西大学生命科学与技术学院;南开大学生命科学学院;中国科学院武汉病毒研究所;广东内伶仃福田国家级自然保护区管理局;生物多样性与生态工程教育部重点实验室复旦大学生命科学学院;上海生物信息技术研究中心 昝启杰 任竹梅 李后魂 李罡 王勇军 王莉 钟扬  出版年:2008
国家重点基础研究发展计划(批准号:2003CB715904);国家自然科学基金(批准号:30570109);国家自然科技资源平台(批准号:2005DKA21403)资助项目
从我国近年来遭受特大虫灾的北部湾沿海红树植物白骨壤上采集害虫标本,测定其线粒体DNA细胞色素c氧化酶亚基Ⅱ(COⅡ)基因序列,并与采自深圳湾白骨壤上的害虫标本以及相关类群的COⅡ基因序列进行同源性比较,结果表明来自北部湾...
关键词:红树林  白骨壤 瘤斑螟属  细斑螟属  COII基因 分子系统发育分析
川崎病丙种球蛋白无反应型易感基因研究
10
《临床儿科杂志》上海交通大学附属儿童医院上海市儿童医院心内科;上海生物信息技术研究中心 陈丽琴 宋思瑞 张晗 宁倩倩 谢利剑 贾佳 肖婷婷 黄敏  出版年:2019
上海申康医院发展中心临床科技创新项目(SHDC12016119);上海市国际科技合作基金项目(No.15410722900);上海市科学技术委员会科研计划项目(No.17411954300);上海交通大学医工交叉青年项目(YG2016QN41)
目的应用靶向测序技术探索川崎病(KD)丙种球蛋白无反应易感基因,筛选KD高危人群。方法选择2016年12月至2018年10月收治的190例KD患儿,其中静脉注射丙种球蛋白(IVIG)无反应33例、敏感151例,以及99例...
关键词:川崎病 静脉滴注丙种球蛋白无反应  基因
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