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江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所 收藏

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研究主题:猪苓    蛋白质    分子对接    基因克隆    药用真菌    

研究学科:自动化类    电子信息类    生物科学类    

被引量:110H指数:6WOS: 9 EI: 1 北大核心: 23 CSCD: 21

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29 条 记 录,以下是 1-10

利用转录组测序挖掘掌叶大黄蒽醌类生物合成相关基因
1
《药学学报》陕西中医药大学药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室;江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所 李欢 张娜 李依民 黑小斌 李元敏 邓翀 颜永刚 刘蒙蒙 张岗  出版年:2018
陕西省高校青年杰出人才支持计划项目;江苏省自然科学基金资助项目(BK20170311);咸阳市中青年科技领军人才项目;陕西中医药大学新进博士科研启动经费(104080001)
蒽醌为中药大黄的主要活性成分,也是大黄质量控制的指标成分。为研究大黄蒽醌类生物合成通路,用Illumina HiSeq^(TM) 2000 150PE对掌叶大黄幼苗转录组文库进行高通量测序,得到11.04G数据,736 ...
关键词:掌叶大黄 转录组 蒽醌 基因  代谢通路
“数字图像处理”课程实验教学研究与探索
2
《电气电子教学学报》江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所 吴全玉 刘晓杰 潘玲佼 陶为戈 诸一琦  出版年:2016
江苏理工学院教学改革与研究项目(jg13065)
本文针对应用型本科"数字图像处理"课程的实验教学,设计了一套以创新应用型人才培养为目标的实践教学体系。提出了以"验证理解-模仿设计-改进创新"为主导的实践教学模式,采用偏重实验过程考核的成绩评定体系。结果表明,该实践教学...
关键词:数字图像处理 实践教学模式 创新能力  
基于融合神经网络模型的药物分子性质预测
3
《计算机科学》江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所;江苏省中以产业技术研究院;江苏理工学院电气信息工程学院;湖州师范学院理学院 谢良旭 李峰 谢建平 许晓军  出版年:2021
国家自然科学基金(12074151,22003020);江苏省自然科学基金(BK20191032);常州市重点研发项目(CJ20200045);江苏省中以产业技术研究院开放课题(JSIITRI202009)。
在生物信息学领域,人工智能方法在预测药物分子的物理化学性质和生物活性中获得了重大成功,特别是神经网络已被广泛应用到药物研发中。但是浅层神经网络的预测精度低,深度神经网络又容易出现过拟合的问题,而模型融合策略有望提升机器学...
关键词:计算机辅助药物设计 生物信息学 模型融合  深度学习  机器学习  
基于转录组数据分析药用真菌猪苓密码子使用偏好性
4
《药学学报》中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所;河北大学中医学院;江苏理工学院电气信息工程学院 刘蒙蒙 邢咏梅 郭顺星  出版年:2020
国家自然科学基金资助项目(81773843,81973425);河北省教育厅基金资助项目(QN2018128);北京协和医学院学科建设项目(201920100901).
本研究以猪苓转录组数据(SRP058382)为基础,利用BLASTx和ESTScan对猪苓的CDS进行预测,共筛选出332条unigenes,再利用CodonW分析这些基因密码子使用偏向性。结果显示,猪苓基因密码子GC含...
关键词:猪苓 转录组 密码子偏向性  最优密码子  
一种结合自适应噪声完备经验模态分解和盲反卷积去除脑电中眼电伪迹的新方法
5
《数据采集与处理》江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所 吴全玉 张文强 潘玲佼 陶为戈 刘晓杰  出版年:2020
江苏省产学研合作项目(BY2019264)资助项目;江苏省重点研发计划(BE2019317,BE2020648)资助项目;江苏省青蓝工程(KYQ19014)资助项目;江苏省高校面上项目(17KJB510015)资助项目。
针对微弱的脑电(Electroencephalogram,EEG)信号在采集过程中夹杂着各种生理伪迹,特别易遭到眨眼和眼动产生的眼电(Electrooculography,EOG)伪迹干扰。本文提出在自适应噪声完备经验模...
关键词:脑电信号 眼电伪迹  经验模态分解 盲反卷积
自适应噪声完备经验模态分解排列熵结合支持向量机的心音分类方法研究 ( EI收录)
6
《生物医学工程学杂志》江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所 刘美君 吴全玉 丁胜 潘玲佼 刘晓杰  出版年:2022
国家自然科学基金青年项目(62001196);江苏省重点研发计划项目(BE2019317,BE2020648)。
针对心音信号非平稳性、非线性的特征,为了更直观地把心音信号的特征显示出来,提高分类识别的高效性,提出了一种自适应噪声完备经验模态分解(CEEMDAN)排列熵作为心音信号的特征向量,通过支持向量机(SVM)进行心音分类识别...
关键词:心音分类  自适应噪声完备经验模态分解  排列熵  支持向量机
蛋白质-配体分子对接中构象搜索方法
7
《数据采集与处理》江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所;常州大学信息科学与工程学院 常珊 陆旭峰 王峰  出版年:2018
NSFC-广东联合基金(第二期)超级计算科学应用研究专项资助项目;国家自然科学基金(11647146;81603152)资助项目;江苏省六大人才高峰(2016-XYDXXJS-020)资助项目;江苏省产学研前瞻(BY2016030-06)资助项目;常州市应用基础研究计划(CJ20160016)资助项目;江苏省研究生科研与实践创新计划(SJCX17_0747)资助项目;江苏省研究生科研与实践创新计划(SJCX17_0748)资助项目
分子对接是研究蛋白质-配体分子间相互作用与识别的有效方法。分子间的相互作用过程中形成的近天然构象是结合自由能极低的构象,快速且准确搜索能量极低的构象对于蛋白质-配体分子对接至关重要。本文回顾了蛋白质-配体分子对接中主要的...
关键词:蛋白质-配体相互作用  构象搜索方法  分子对接
基于多特征融合的运动想象脑电信号分类研究
8
《现代计算机》江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所;扬州工业职业技术学院 陆振宇 陆旭峰 杨瑞洪 常珊  出版年:2019
NSFC-广东联合基金(第二期)超级计算科学应用研究专项;国家自然科学基金(No.11647146;81603152);江苏省六大人才高峰资助项目(No.2016-XYDXXJS-020);江苏省产学研前瞻资助项目(BY2016030-06);江苏省研究生科研与实践创新计划资助项目(No.SJCX17_0747);江苏省研究生科研与实践创新计划资助项目(No.SJCX17_0748);江苏省"青蓝工程"优秀青年骨干教师项目(苏教办师[2017]5号)
针对脑机接口(BCI)系统中常用的运动想象脑电信号,提出多特征融合的方法,提高其分类准确率。采用自回归(AR)模型、小波包变换、共空间模式(CSP)对BCI2003竞赛数据进行信号处理,提取AR模型系数、小波包熵差、方差...
关键词:运动想象  AR模型 小波包变换 共空间模式  
生物信息学高性能教学平台的建立与实践
9
《实验室研究与探索》江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所;华南农业大学信息学院 常珊 曾玲 万华  出版年:2015
国家自然科学基金(31200990);全国教育信息技术研究"十二五"规划2012年度专项课题(126230657);广东省优秀青年教师培育计划项目(Yq2013027);华南农业大学信息学院教育教学改革与研究项目(INFJG1009)
随着生命科学实验数据的高速积累和增长,生物信息学成为生命科学研究型人才必须掌握的重要技能。从高性能计算和生物信息学的关系入手,简述了生物信息学教学中采用高性能计算设备的必要性。根据农业院校的具体情况,在生物信息学教学中建...
关键词:高性能计算  案例教学 生物信息
猪苓菌核自噬相关基因ATG8的克隆及表达分析
10
《中国医药生物技术》中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所;江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所 刘蒙蒙 邢咏梅 郭顺星  出版年:2016
国家自然科学基金(30830117;31201666);山西省煤基重点科技攻关项目(FT2014-03);河北山区特色中药材种质资源评价与仿野生栽培技术研究与示范(16232503D)
目的克隆分离猪苓自噬相关基因ATG8,并探讨其在猪苓防御蜜环菌入侵过程中的作用。方法以猪苓菌核为材料,采用RT-PCR方法得到自噬相关基因的开放读码框全长,并利用荧光定量PCR检测该基因在不同猪苓菌核部位的表达量。结果该...
关键词:猪苓 自噬 基因表达 克隆
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