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南京医科大学生物医学工程与信息学院生物信息学系

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研究主题：加权评分 RANGER 测序技术 HI

研究学科：生物科学类

被引量：1H指数：1WOS: 1 北大核心: 3 CSCD: 4

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控制混杂因素的基于随机森林方法评价: 1; 《中国卫生统计》江苏省中医院;南京医科大学公共卫生学院生物统计学系;南京医科大学生物医学工程与信息学院生物信息学系;昆明医科大学公共卫生学院梁君雅赵杨段巍巍何杰宇魏永越陈峰出版年：2022; 国家重点研发计划“战略性国际科技创新合作”重点专项项目(2016YFE0204900);国家自然科学基金项目(81973142);江苏省中医院院级创新发展基金专项课题(Y2019CX15)。; 目的在高维组学研究中,混杂因素常常影响着随机森林筛选出与研究结局相关联的变量的能力,因此控制混杂因素具有非常重要的作用。方法通过模拟试验和实例验证,我们比较了以下四种方法在筛选与研究结局相关联的变量中控制混杂因素的效果:...; 关键词：混杂随机森林 RANGER 加权重要性评分

人类新生突变的起源、特征及其对子代健康的影响: 2; 《中国细胞生物学学报》南京医科大学生殖医学与子代健康全国重点实验室;南京医科大学公共卫生学院流行病学系;南京医科大学生物医学工程与信息学院生物信息学系周俊朱佳雯王铖胡志斌出版年：2024; 国家自然科学基金优秀青年科学基金项目(批准号:82322032);国家自然科学基金创新研究群体项目(批准号:82221005);国家重点研发计划(批准号:2021YFC2700601);江苏省杰出青年基金项目(批准号:BK20220050)资助的课题。; 除来自祖先的遗传变异外,人类还携带了每一世代新产生的突变,即新生突变。近年来,基于“父-母-子代”核心家系设计的高通量测序研究初步解析了这些新生突变的起源和特征,并且发现新生突变是多种疾病(例如神经发育障碍、先天性心脏病...; 关键词：新生突变突变起源子代健康

染色质互作相关转录因子的挖掘及功能分析: 3; 《生物化学与生物物理进展》南京医科大学生物医学工程与信息学院生物信息学系王琪丁砚书耿宝宝聂玉敏出版年：2019; 江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20161026);江苏省高校自然科学研究面上项目(16KJB180022);南京医科大学科技发展基金重点项目(2015NJMUZD003)资助~~; 染色质互作是真核生物基因组组装的基础,并且在调控真核基因细胞特异性表达中发挥重要作用.染色质互作的发生与特定的蛋白质有关,目前已经发现CTCF (CCCTC binding facor,转录阻抑物)和黏连蛋白与染色质互作...; 关键词：染色质互作转录因子 FP-GROWTH Hi-C

细菌演化研究的进展: 4; 《中华微生物学和免疫学杂志》南京医科大学杨一子出版年：2018; 细菌演化研究在测序技术的支持下获得了大量成果。研究范围从代表性种类向其他种类持续扩大,研究层次从单一序列迅速推进至整个基因组。本文以细菌演化的研究对象、研究发现和研究工具为线索,较详细地介绍了近些年来细菌演化研究及所用工...; 关键词：细菌演化研究测序技术基因组

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