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南京农业大学生物信息学中心 收藏

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研究主题:木质纤维素    高性能计算平台    生物信息    降解菌    全基因组分析    

研究学科:生物科学类    电子信息类    

被引量:33H指数:2WOS: 2 北大核心: 3 CSCD: 3

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5 条 记 录,以下是 1-5

一株木质纤维素降解菌的筛选及其全基因组分析
1
《微生物学报》南京农业大学生物信息学中心 鲍文英 江经纬 周云 吴玉峰 梁志清  出版年:2016
【目的】筛选和鉴定有木质纤维素降解能力的1株细菌,测定其相关酶活力并进行全基因组分析,为构建木质纤维素降解工程菌提供依据。【方法】采用3种木质素类似物(天青-B;酚红;愈创木酚)的脱色/染色法,从腐木和被枝叶覆盖的土壤中...
关键词:木质纤维素降解菌  筛选  拉乌尔属  全基因组 代谢通路
假黄单胞菌株J1的筛选及木质纤维素降解基因的生物信息学分析
2
《南京农业大学学报》南京农业大学生物信息学中心/生命科学学院 侯丽媛 江经纬 蒋建东 许志辉 梁志清  出版年:2016
[目的]本研究旨在发掘木质纤维素降解菌种资源,并寻找木质纤维素降解关键酶基因和代谢通路。[方法]以纤维素为唯一碳源,从土壤、腐叶混合物中分离出27株具有纤维素降解能力的细菌。通过测定纤维素酶活力,将降解效果最优菌株进行全...
关键词:木质纤维素 假黄单胞菌属  细菌基因组 生物信息学  生物乙醇  
生物信息高性能计算平台的建设与实践——以南京农业大学为例
3
《高校实验室科学技术》南京农业大学生物信息学中心;南京农业大学信息科学技术学院 段荣静 刘金定  出版年:2019
南京农业大学基本科研业务费实验室设备专项基金(项目编号:SYSB201825)
高性能计算在生命科学研究中的需求日益增长,已成为高校生命科学科研创新的一个重要手段。在此背景下,南京农业大学在“双一流建设”经费支持下建设了生物信息高性能计算共享平台。本文介绍了生物信息高性能计算平台的建设情况,并对提升...
关键词:生物信息 高性能计算平台 建设  运行机制  
生物信息高性能计算平台的建设与实践——以南京农业大学为例
4
《高校实验室科学技术》南京农业大学生物信息学中心;南京农业大学信息科学技术学院 段荣静 刘金定  出版年:2019
南京农业大学基本科研业务费实验室设备专项基金(项目编号:SYSB201825)
高性能计算在生命科学研究中的需求日益增长,已成为高校生命科学科研创新的一个重要手段。在此背景下,南京农业大学在“双一流建设”经费支持下建设了生物信息高性能计算共享平台。本文介绍了生物信息高性能计算平台的建设情况,并对提升...
关键词:生物信息 高性能计算平台 建设  运行机制  
基于RNA-seq的基因训练集构建方法
5
《数据采集与处理》南京农业大学领域知识关联研究中心;南京农业大学生物信息学中心 段荣静 刘金定  出版年:2018
国家自然科学基金(31301691)资助项目;教育部中央高校基本业务费(KYZ201667;KJQN201430)资助项目
针对基因组新测序物种缺乏高质量的基因结构用于从头预测软件训练的现状,本文提出了一种以新测序物种自身RNA-seq组装为基础的可靠基因训练集构建方法(Building reliable training gene set,...
关键词:生物信息学 基因结构 RNA-SEQ 蛋白同源  训练基因集  
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