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天津师范大学生命科学学院生物信息与药物开发研究所 收藏

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研究主题:生物信息学    量子化学    蛋白质    分子模拟    蛋白质结构    

研究学科:生物科学类    

被引量:35H指数:4WOS: 5 EI: 1 北大核心: 6 CSCD: 7

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基于中药数据库的HIV抑制剂的筛选
1
《药学学报》天津师范大学生物信息与药物开发研究所;天津药物研究院;武警医学院 高维娜 李云 张瑞 高慧 徐为人 李爱秀 杜奇石 张欣 魏冬青  出版年:2006
天津市科委基础科学重点项目(033801911);计算专项基金资助项目.
目的用现代化学信息学手段和中药化学数据库寻找新的抗H IV药物。方法利用现有的抗H IV的药物作模版,进行中药分子数据库搜索,然后采用分子对接方法得到H IV-1蛋白酶受体与亚叶酸的合理复合物结构,用分子动力学方法对对接...
关键词:蛋白酶抑制剂 中药分子数据库搜索  分子对接 分子动力学 亚叶酸
依据氨基酸残基的相关性预测蛋白质的结构类型 ( SCI收录)
2
《物理化学学报》天津师范大学生物信息与药物开发研究所;辽宁大学物理系 王树青 刘红 杜奇石 魏冬青  出版年:2004
国家自然科学基金(20373048);天津市科委基础科学(023618211)资助项目~~
作为蛋白质的建筑构件,各种类型的蛋白质的20种氨基酸残基之间存在着特定的相互关联,反映了氨基酸残基之间的制约性,并有深刻的物理和化学的内在因素.某些氨基酸残基对之间的相关系数可以作为一种类型的蛋白质区别于其它类型蛋白质的...
关键词:氨基酸残基 蛋白质 相关性系数  正确率 欧几里德距离法  生物信息学 分子生物学 生物技术  
(R)-N-[[3-[3-氟-4-吗啉基]苯基]-2-氧代-5-噁唑烷基]甲醇的合成
3
《天津师范大学学报(自然科学版)》天津药物研究院;天津师范大学生物信息与药物开发研究所 李云 黄长江 高慧 高维娜 刘登科 徐为人 杜奇石 魏冬青  出版年:2005
天津市科委基础科学重点资助项目(033801911)
利奈唑酮是新上市的一种口恶唑烷酮类全合成抗菌药,本研究对其关键中间体(R)-N-[[3-[3-氟-4-吗啉基]苯基]-2-氧代-5口-恶唑烷基]甲醇(1)的合成方法做了改进.合成3-氟-4-吗啉基硝基苯时,用价廉易得的三...
关键词:噁唑烷酮 利奈唑酮 工艺改进  
HIV蛋白酶多肽抑制剂的理论研究
4
《原子与分子物理学报》天津师范大学生物信息与药物开发研究所;天津药物研究院 高慧 高维娜 李云 徐为人 李娜 蒋志勤 杜奇石 魏冬青  出版年:2006
天津市科委基础科学重点项目(033801911);计算专项的资助和中国科学院计算机网络信息中心计算化学虚拟试验室和超级计算中心的支持.
艾滋病病毒的发现距今已有二十多年的历史了.它仍然以很快的速度在全球范围速蔓延.研发抗艾滋病药物是当代药学的重大课题之一.在以往研究的基础上,我们利用分子叠合和分子对接这两种分子模拟手段,把从PDB数据库中得到的与HIV蛋...
关键词:HIV 蛋白酶 多肽抑制剂  分子模拟
蛋白质中氨基酸间的相关性研究
5
《天津师范大学学报(自然科学版)》天津师范大学生物信息与药物开发研究所 王树青 杜奇石 魏冬青 李爱秀  出版年:2004
国家自然科学基金资助项目(20373048);天津市科委基础科学重点资助项目(033801911)
计算和分析了4种类型(α型、β型、α/β型和α+β型)共计204个蛋白质中的20种氨基酸间的相关性.研究发现,氨基酸之间的相关性可分为强正相关、强负相关、弱相关和不相关.作为蛋白质的建筑构件,20种氨基酸在不同类型的蛋白...
关键词:氨基酸 蛋白质结构 生物信息学 化学计量学
药物基因组学与个性化药物设计研究进展
6
《药学进展》上海交通大学生命科学技术学院;天津师范大学生物信息与药物开发研究所;郑州大学化学系;西北大学生命科学院 张瑞 魏冬青 魏华春 屈凌波 李如林 陈超 李亦学  出版年:2007
药物基因组学是采用基因组学的信息和研究方法,通过分析DNA的遗传变异和监测基因表达谱,以阐明药物反应差异的遗传学本质。这不仅有利于根据药物代谢和药物反应的遗传学特点指导合理用药,而且有利于开发和设计新的药物。综述药物基因...
关键词:药物基因组学 药物遗传学 最优化治疗  药物开发
分子亲脂-亲水性的量子化学描述(Ⅰ)——分子的亲脂和亲水表面 ( EI收录)
7
《高等学校化学学报》天津师范大学生物信息与药物开发研究所 杜奇石 魏冬青 李爱秀  出版年:2004
国家自然科学基金(批准号:20373048);天津科委重点科学项目(批准号:033801911)资助.
给出基于分子结构的“启发式”亲脂 -亲水势 HMLP ( Heuristic molecular lipophilicity-hydrophilicitypotential)的理论分析和有说服力的算例 .用量子化学计算其...
关键词:亲脂-亲水势(HMLP)  分子模拟 生物信息学 药物分子设计 量子化学
分子亲脂-亲水性的量子化学描述 II.氨基酸侧链的亲水指标和亲脂指标
8
《化学学报》海南师范大学化学系;天津师范大学生物信息与药物开发研究所 杜奇石 刘朋军 孙浩 李大鹏 谢军民  出版年:2006
国家自然科学基金(No.20373048);天津市科委基础科学基金资助项目.
在启发式亲脂势HMLP(heuristicmolecularlipophilicitypotential)的基础上提出了分子、分子片段和原子的亲水指标和亲脂指标.计算出了20个天然氨基酸侧链的亲水、亲脂指标和亲水、亲脂表...
关键词:启发式亲脂势(HMLP)  亲脂指标  蛋白质  氨基酸  生物信息学
四聚甲基锂Li_4(CH_3)_4的电子结构的量子化学研究
9
《天津师范大学学报(自然科学版)》滨州师范高等专科学校;天津师范大学生物信息与药物开发研究所 刘亨 杜奇石 孙玉彬 王树青  出版年:2004
国家自然科学基金资助项目(20373048);天津市科委基础科学重点资助项目(023618211)
用Gaussian98W程序对四聚甲基锂Li4(CH3)4的电子结构作了量子化学计算,根据分子轨道能级、电子密度集居数分析、原子电荷、化学键键级等对Li4(CH3)4的缺电子多中心键的特点进行了理论解释.计算表明在Li4...
关键词:金属有机化合物 5中心2电子键  分子轨道理论 量子化学
SARS冠状病毒主蛋白酶可切割多肽的搜索与生物信息学的应用
10
《湘潭大学自然科学学报》天津师范大学生物信息与药物开发研究所 孙浩 杜奇石 王树青 谢军民 李大鹏  出版年:2004
国家自然科学基金资助项目 (2 0 3730 48) ;天津市科委基础科学重点项目 (0 3380 1 91 1 )
用新近发展的冠状病毒的基因解析软件系统ZCURVE -CoV 1 .0和ZCURVE -CoV 2 .0(http ://tubic .tju .edu .cn/sars/)分析了基因库 (NCBIRefSeqproje...
关键词:SARS SARS冠状病毒主蛋白酶  多肽的剪切性  抑制剂 变形钥匙  
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