期刊文章详细信息
依据氨基酸残基的相关性预测蛋白质的结构类型 ( SCI收录)
Prediction of Protein Structural Classes Based on Correlations of Amino Acid Residues
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]天津师范大学生物信息与药物开发研究所,天津300074 [2]辽宁大学物理系,沈阳110036
基 金:国家自然科学基金(20373048);天津市科委基础科学(023618211)资助项目~~
年 份:2004
卷 号:20
期 号:5
起止页码:498-502
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EBSCO、IC、INSPEC、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCI(收录号:WOS:000221624700011)、SCI-EXPANDED(收录号:WOS:000221624700011)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:作为蛋白质的建筑构件,各种类型的蛋白质的20种氨基酸残基之间存在着特定的相互关联,反映了氨基酸残基之间的制约性,并有深刻的物理和化学的内在因素.某些氨基酸残基对之间的相关系数可以作为一种类型的蛋白质区别于其它类型蛋白质的特征,用于蛋白质结构类型的预测.研究了4种类型的蛋白质204个样品的氨基酸残基对的相关性系数,找出了可作为蛋白质结构类型特征的氨基酸残基的相关对,并用于蛋白质结构类型的预测,对于α型、β型、α/β型和α+β型蛋白质的204个蛋白质样品的交叉测试,正确率分别为94%、89%、79%和89%,平均为88%,高于简单距离法和欧几里德距离法.
关 键 词:氨基酸残基 蛋白质 相关性系数 正确率 欧几里德距离法 生物信息学 分子生物学 生物技术
分 类 号:O629]
参考文献:
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引证文献:
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