于1986年、1989年和1992在北京大学分别获得化学专业学士学位、环境化学专业硕士学位和理学博士学位。1994年至1996年在荷兰应用科学研究组织（TNO）和Utrecht大学从事博士后研究工作。1997年回国后，开始在中国气象科学研究院工作至今，主要从事大气化学和区域大气环境的模式模拟研究，目前任中国气象科学研究院气候与环境变化中的物理化学过程研究领域首席研究员、中国气象局大气成分观测与服务中心化学输送数值模拟研究关键岗位研究员，还担任中国气象学会大气化学分会委员、中国环境学会大气环境分会委员、《科学通报》特约编辑、《自然科学进展》、《气象学报》和《应用气象学报》编委等职。2000年12月至2001年3月，美国纽约州里大学Albany分校大气科学研究中心访问学者；2003年4-5月、2005年3月和11月、2007年1月、6-7月和11月，德国马普化学所访问学者。曾获2003年中国气象局青年科学奖。 马建中博士长期从事大气化学观测资料分析与模式模拟研究工作，在平流层臭氧减少与大气紫外辐射、对流层臭氧光化学、区域臭氧的收支和源贡献、大气硝酸盐气粒平衡、污染物源排放清单评估等方面取得了优秀的研究成果，在国际著名期刊上有10余篇论文发表。