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山东理工大学生命科学学院山东省生物信息工程技术研究中心 收藏

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研究主题:描述符    化学信息学    聚类分析    定量构效关系研究    定量构效关系    

研究学科:生物科学类    自动化类    

被引量:44H指数:3北大核心: 7 CSCD: 7

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9 条 记 录,以下是 1-9

定量构效关系研究中分子描述符的相关性
1
《计算机与应用化学》山东理工大学生命科学学院 任伟 孔德信  出版年:2009
山东理工大学创新团队建设项目的资助
分子描述符的计算是定量构效关系(QSAR)研究的基础,也是化学计量学研究的重要内容,在药物化学、环境科学等领域应用广泛。目前可计算的各种分子描述符已超过4 000种,如何选择合适的分子描述符,成为QSAR研究中首先要做的...
关键词:分子描述符  定量构效关系 相关分析  聚类分析
分子相似性与MOLPRINT2D的本地化
2
《计算机与应用化学》山东理工大学化学工程学院;山东理工大学生命科学学院 吴萍 孔德信  出版年:2008
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助.
分子相似性是分子多样性、分子聚类分析的基础,在药物、材料设计等领域应用广泛。分子相似性有相似度和分子间距两种方式表示,它的计算以分子描述符的计算为前提,依据所采用的描述符是定量还是定性表示,其算法有所不同。本文首先简述了...
关键词:分子相似性  分子设计 描述符 MOLPRINT  2D  
计算机存储化学结构的格式及其相互转化
3
《计算机与应用化学》山东理工大学生命科学学院山东省生物信息工程技术研究中心 孔德信  出版年:2007
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助.
在计算机中存储化学结构是化学信息学首先要解决的问题,由于历史的原因,现在化学结构存储的文件格式多不胜数,给相关研究工作带来了诸多不便。本文首先综述分子结构在计算机中常见的编码方式,介绍化学结构存储的常用文件格式,讨论分子...
关键词:化学信息学 分子模拟 分子的结构  文件格式  BABEL
化合物成药性的预测方法
4
《计算机与应用化学》山东理工大学生命科学学院;华中农业大学生命科学技术学院生物信息中心;华中农业大学农业微生物国家重点实验室 李晓 孔德信  出版年:2012
国家自然科学基金资助项目(21075046);华中农业大学研究生教育创新工程项目(2010KC07)
为了降低药物开发后期的失败率,指导侯筛化合物库的设计,药物化学家提出了许多基于化学信息学或计算化学的"成药性"理论指标,这些预测方法日益成熟,取得了广泛应用。本文综述了现有的化合物成药性预测方法的研究进展,包括类药性、类...
关键词:成药性  类药性 类先导性  天然产物类似物  生物相关性  
生物信息学和化学信息学网络研究平台的构建
5
《计算机与应用化学》山东理工大学生命科学学院山东省生物信息工程技术研究中心 孔德信 张红雨  出版年:2007
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助.
生物信息学和化学信息学均需要利用计算机和网络作为其研究平台,从网络中获取数据,利用远程计算机完成计算分析任务;同时,生物信息学和化学信息学软件分布在Unix、Linux和Windows等不同的操作系统平台上。因此,对从事...
关键词:生物信息学 化学信息学 网络研究平台  X—server  跨系统  远程图形登录  
基于配体和受体的药物设计方法的对应性
6
《生命科学仪器》山东理工大学生命科学学院 任伟 孔德信  出版年:2009
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019)
基于配体和基于受体的药物设计,通常在方法设计上存在共同的理论基础。本文通过对基于格点能量计算、特征、类似物、知识以及分子对接等方面的方法进行总结,探讨了基于配体和受体在药物设计中的对应关系,并对今后药物设计的发展提出建议...
关键词:基于受体的药物设计  基于配体的药物设计  对应性  
丙型肝炎病毒的非结构蛋白3抑制剂
7
《生命的化学》山东理工大学生命科学学院 吕巍 孔德信  出版年:2007
山东理工大学博士科研启动基金(No.405019);山东理工大学生命科学学院特色学科基金资助
丙型肝炎严重威胁人类健康,非结构蛋白3(NS3)在丙型肝炎病毒(HCV)多聚蛋白水解过程中起重要作用,被公认为治疗丙型肝炎的有效药物靶标。该文介绍目前国内外有关NS3蛋白酶抑制剂(包括寡肽类抑制剂和非肽小分子抑制剂)的研...
关键词:丙型肝炎病毒(HCV)  非结构蛋白3(NS3)  抑制剂
4种常用化学作图软件功能之比较
8
《计算机与应用化学》山东理工大学生命科学学院 吕巍 孔德信  出版年:2008
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助。
随着计算机技术的发展和普及,化学化工工作者应用化学专业软件也越来越普遍。ChemDraw、ChemSkech、ChemWin、I- SIS/Draw是目前最常用的4种化学作图软件。本文从化学作图、辅助化学专业分析、性质预...
关键词:化学作图软件  辅助分析  计算机辅助化学教学
生物小分子与蛋白质相互作用的信息挖掘
9
中国化学会第三届全国生物物理化学会议暨国际华人生物物理化学发展论坛 2014纪洪芳  出版年:2014
生命体内许多重要的生物过程依靠生物小分子和蛋白质等大分子的相互作用,同时该相互作用又是药物发挥药效和药物设计研究的基础。通过综合运用计算生物学、生物信息学、计算机辅助药物设计和量子化学计算等理论方法并结和生物物理学等实验...
关键词:生物小分子 蛋白质 分布模式  发病机理 耐药性机理  
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