文献类型：期刊文章

作　　者：崔爱利[1] 许文波[1] 李秀珠[2] 胡家瑜[2] 凌华[3] 唐伟[2] 杨智宏[4] 张燕[1] 陈立[1] Hiroyuki Shimizu[5]

机构地区：[1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京100052 [2]上海市疾病预防控制中心,上海200336 [3]重庆市疾病预防控制中心,重庆400042 [4]复旦大学附属儿科医院,上海200032 [5]日本国立卫生研究院

出　　处：《病毒学报》

基　　金：WHO资助;项目编号(WP/CHN/IVD/001/RB02)

年　　份：2004

卷　　号：20

期　　号：2

起止页码：160-165

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%～94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%～84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%～100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%～93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源?

关 键 词：肠道病毒71型 RT-PCR 诊断  基因 分子流行病学

分 类 号：R373.2]