文献类型：期刊文章

作　　者：胡昌华[1] 鲍朗[2] 毕小君[1]

机构地区：[1]西南师范大学现代生物医药研究所生命科学学院,重庆400715 [2]四川大学华西医学中心,四川成都610041

出　　处：《西南师范大学学报（自然科学版）》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30070670);重庆市应用基础研究资助项目(2002-7481).

年　　份：2004

卷　　号：29

期　　号：3

起止页码：434-438

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2000、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、MR、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：对24个已鉴定的赖型致病钩端螺旋体特异消减片段进行DNA序列测定和生物信息学分析.结果显示,片段两端皆含有AluⅠ酶切位点,片段大小为149～1506bp,平均480bp,GC含量平均为36 63%.其中6个序列无任何同源匹配序列,提示可能来自新基因;18个同源序列可分为两类:与外膜蛋白或假想蛋白相关,与生化代谢修饰相关的酶.在Genbank中登记其中20个序列,序列号分别为AF300873-AF300877,AF325807-AF325821.这些基于生物信息学的功能预测,将有助于在此基础上进行相关的基因克隆鉴定、表达分析及功能验证.

关 键 词：钩端螺旋体 差异消减片段  序列测定  生物信息学

分 类 号：R377.5]