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期刊文章详细信息

鼠疫耶尔森菌菌株91001全基因组序列测定及初步分析    

Detection and analysis of complete genome sequence of Yersinia pestis human-avirulent strain 91001

  

文献类型:期刊文章

作  者:宋亚军[1] 童宗中[1] 王津[1] 郭兆彪[1] 汪莉[2] 韩延平[1] 张建国[3] 裴德翠[1] 周冬生[1] 秦海鸥[3] 庞昕[1] 韩玉军[3] 翟俊辉[1] 李敏[4] 祁芝珍[4] 金丽霞[4] 戴瑞霞[4] 崔百忠[4] 陈峰[3] 李胜霆[3] 叶辰[3] 杜宗敏[1] 王效义[1] 王俊[3] 于军[3] 杨焕明[3] 汪建[3] 黄培堂[2] 杨瑞馥[1]

机构地区:[1]北京军事医学科学院微生物流行病研究所,100071 [2]军事医学科学院生物工程研究所 [3]中国科学院北京基因组研究所 [4]青海省地方病预防控制所

出  处:《解放军医学杂志》

基  金:国家"8 63"基金 (编号 2 0 0 1AA2 2 30 61 );国家自然科学基金 (编号30 371 2 84)资助课题

年  份:2004

卷  号:29

期  号:3

起止页码:192-199

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的 测定对人不致病的鼠疫耶尔森菌布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1的全基因组序列 ,并通过比较基因组学研究 ,探索鼠疫耶尔森菌致病性的遗传学机制和进化路线。方法 采用全基因组鸟枪法测定 910 0 1菌株的全基因组序列 ,利用比较基因组方法对 910 0 1与另外 2株鼠疫耶尔森菌(CO92和KIM)的全基因组进行比较研究。结果 910 0 1菌株的基因组包括 1条染色体和 4个质粒 (pPCP1、pCD1、pMT1和pCRY)。pPCP1质粒长度为 96 0 9bp,与参考菌株基本一致 ;pCD1质粒是编码Ⅲ型分泌系统的质粒 ,长度为70 15 9bp,编码情况与参考菌株基本相同 ,但重排导致了质粒的结构与参考菌株存在差异 ;pMT1质粒长度为10 6 6 4 2bp,保留了较多的原始质粒片段 ,毒力相关基因与参考菌株没有差异 ;pCRY质粒是本研究中新发现的质粒 ,在国内外研究中未曾报道 ,这一质粒长度为2 174 2bp ,具有独立复制能力 ,有一群编码Ⅳ型分泌系统的基因。 910 0 1菌株的染色体长度为4 5 95 0 6 5bp,有 4 0 37个编码序列 (CDS) ,其中 14 1个是假基因 ;染色体中存在着非常丰富的插入序列 ,由于存在IS序列介导的基因组重排 ,910 0 1菌株染色体的结构与参考菌株存在较大差异。通过比较基因组学分析 ,初步确定了910 0 1菌株甘油降解阳性、硝酸盐还原阴性、阿拉?

关 键 词:耶尔森氏菌 鼠疫 基因组 进化 序列分析  DNA  

分 类 号:R378.61]

参考文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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