文献类型：期刊文章

作　　者：陈艳炯[1] 邓亚军[1] 叶琳[2] 耿佳宁[3] 李生斌[1]

机构地区：[1]西安交通大学医学院法医系,陕西西安710061 [2]杭州华大基因研究中心,浙江杭州310007 [3]北京华大基因研究中心,北京101300

出　　处：《第四军医大学学报》

基　　金：中国丹麦合作家猪基因组计划 (2 0 0 2AA2 2 90 61 )

年　　份：2003

卷　　号：24

期　　号：20

起止页码：1837-1840

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、IC、JST、ZR、核心刊

摘　　要：目的 :构建家猪 1 0 0d胚胎胸腺基因表达谱 ,为研究胸腺的发育和分化机制奠定基础 .方法 :随机挑取家猪1 0 0d胸腺cDNA文库 (FTY)的 1 1 71 2个克隆 ,进行单向全自动大规模测序 ,去污染后共获得 70 71个高质量的表达序列标签 (EST)用于基因表达分析 .结果 :对 70 71个高质量EST的聚类分析结果获得 95 9个多拷贝基因和 30 74个单拷贝基因 .与非冗余的核酸数据库、Swiss Prot数据库及人、牛和鼠的U nigene数据库进行BLAST ,发现 80 6个多拷贝基因和 1 6 6 9个单拷贝基因 (共计 5 4 4 2个ESTs)与已知序列有同源性 ,1 6 2 9个EST没有发现同源序列被认为是新基因 .根据功能将已知基因归为 7类 ,其中基因表达相关基因占 36 .99% ,胸腺特异的防御功能相关基因有一定程度表达 (占 7.5 5 % ) ,这与人婴儿胸腺基因表达谱相类似而不同于成年人胸腺组织 .将 1 0 9个既发现有ORF又具有PolyA的多拷贝新基因与人类基因组框架序列进行BLAST ,发现其中 5 8个有同源序列 .结论 :EST技术是发现新基因的有效手段之一 ;此期家猪胸腺仍处于发育阶段 .

关 键 词：猪  胸腺/胚胎学  EST

分 类 号：Q456] Q343.1