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三疣梭子蟹线粒体DNA 16S rRNA和COI基因片段序列的比较研究
A Study of the Sequences of Mitochondrial 16S rRNA and COI Gene Fragments of Portunus trituberculatus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室,山东青岛266003 [2]中国水产研究院黄海水产研究所,山东青岛266071
基 金:海洋渔业资源可持续利用农业部重点开放实验室资助
年 份:2004
卷 号:34
期 号:1
起止页码:22-28
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、ZR、核心刊
摘 要:本文采用 PCR扩增和序列测定等技术 ,对三疣梭子蟹 (Portunustrituberculatus)线粒体DNA1 6Sr RNA和 COI基因片段进行了初步研究。经 PCR扩增和序列测定 ,分别得到 1 6Sr RNA和 COI2个基因片段的碱基序列 ,其中 1 6Sr RNA基因片段的大小为 566bp,碱基 A,T,G,C的含量分别为 35.1 6% ,34.45% ,1 2 .37%和 1 8.0 2 % ;COI基因片段的大小为 658bp,碱基 A,T,G,C的含量分别为 36.63% ,2 6.44% ,2 0 .52 %和 1 6.41 %。在 2种基因片段中 ,AT含量均明显高于 GC含量 ,这与果蝇、虾类、蟹类等无脊椎动物的 1 6Sr RNA和 COI基因片段研究结果相似。通过对三疣梭子蟹 1 6S r RNA和 COI2个基因片段遗传特征的研究 ,发现其种内变异较低 ,在 3个样本中 1 6Sr RNA基因片段序列完全一样 ,COI基因片段中也只有 2个 T/ C位点转换。另外 ,比较本研究所得序列与 Gen Bank中梭子蟹科 5个属的 1 6Sr RNA基因片段序列后 ,发现其聚类结果与传统分类相一致。
关 键 词:三疣梭子蟹 16S RRNA基因 COI基因 PCR 片段序列
分 类 号:Q178.53] Q953]
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