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HPCL2基因表达的选择性剪切分析 ( SCI收录)
Expression Regulation Analysis of HPCL2 Gene by In silica Alternative Spli cing
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国科学院遗传与发育生物学研究所人类基因组中心 [2]杭州华大基因研究中心,杭州380001
基 金:国家高技术"86 3"计划资助项目( 86 3 J1 9);中国科学院创新工程资助项目(KSCX1 D4 )~~
年 份:2003
卷 号:30
期 号:6
起止页码:919-922
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、SCI(收录号:WOS:000224108900018)、SCI-EXPANDED(收录号:WOS:000224108900018)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:2 羟基植烷酸辅酶A裂解酶 (2 hydroxypanthyl CoAlyase ,HPCL2 )是 3 甲基脂肪酸α 氧化途径中的关键酶 .采用鸟枪法测序技术 ,得到了HPCL2基因的基因组序列 .结果显示 ,HPCL2基因组大小为 40 82 9bp ,共有 17个外显子 ,16个内含子 .外显子平均大小为 116bp ,内含子平均大小为 2 42 9bp ,属于结构紧凑基因 .从dbEST数据库中筛选与HPCL2基因的mRNA (GenBankAcc .:AJ13 1753 )相互重叠表达序列标签 (EST)共有2 13个 ,分别来自 2 9个不同的组织 .将EST与基因组序列进行Blast分析 ,共检测 17个EST具有选择性剪切 ,其中 14例属外显子遗漏 (exonskipping) ,2例外显子增加 (exoninclusion)和 1例剪切位点改变 (splicingsiteshift) .外显子遗漏主要发生在 5′端的第 3到第 8个外显子 .结果表明 。
关 键 词:基因结构 选择性剪切 外显子遗漏 HPCL2基因 基因表达
分 类 号:Q753] Q786
参考文献:
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引证文献:
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同被引文献:
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