文献类型：期刊文章

作　　者：李骜[1] 王涛[1] 冯焕清[1] 王明会[1]

机构地区：[1]中国科学技术大学生物医学工程研究所,合肥230026

出　　处：《生物物理学报》

基　　金：中国科学院知识创新工程重大项目;中国科技大学高水平大学建设重点项目

年　　份：2003

卷　　号：19

期　　号：4

起止页码：431-436

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2000、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：采用基于贝叶斯网络的建模方法,预测真核生物DNA序列中的剪接位点。分别建立了供体住点和受体位点模型,并根据两种位点的生物学特性,对模型的拓扑结构和上下游节点的选择进行了优化。通过贝叶斯网络的最大似然学习算法求出模型参数后,利用10分组交互验证方法对测试数据进行剪接位点预测。结果显示,受体位点的平均预测准确率为92.5％,伪受体位点的平均预测准确率为94.0％,供体位点的平均预测准确率为92.3％,伪供体位点的平均预测准确率为93.5％,整体效果要好于基于使用独立和条件概率矩阵、以及隐Markov模型的预测方法。表明利用贝叶斯网络对剪接位点建模是预测剪接位点的一种有效手段。

关 键 词：贝叶斯网络 DNA序列 剪接位点 供体位点  受体位点 遗传信息

分 类 号：Q523] Q617