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期刊文章详细信息

健康与感染青枯病烟株根际土壤与茎秆细菌群落结构与多样性    

Bacterial community structure and diversity of rhizosphere soil and stem of healthy and bacterial wilt tobacco plants

  

文献类型:期刊文章

作  者:向立刚[1,2] 周浩[1,2] 汪汉成[2] 李震[3] 陈乾丽[4] 余知和[1]

Ligang Xiang;Hao Zhou;Hancheng Wang;Zhen Li;Qianli Chen;Zhihe Yu(College of Life Sciences,Yangtze University,Jingzhou434025,Hubei Province,China;Guizhou Academy of Tobacco Science,Guiyang550081,Guizhou Province,China;Qianxinan Zhou Company,Guizhou Tobacco Companies,Xingyi562400,Guizhou Province,China;College of Agriculture,Guizhou University,Guiyang550025,Guizhou Province,China)

机构地区:[1]长江大学生命科学学院,湖北荆州434025 [2]贵州省烟草科学研究院,贵州贵阳550081 [3]贵州省烟草公司黔西南州公司,贵州兴义562400 [4]贵州大学农学院,贵州贵阳550025

出  处:《微生物学报》

基  金:中国博士后科学基金(2017M610585);中国烟草总公司科技项目(110201601025(LS-05),110201502003);中国烟草总公司贵州省公司科技项目(201705,201714,201914);贵州省科技厅优秀青年人才培养计划(黔科合平台人才[2017]5619)~~

年  份:2019

卷  号:59

期  号:10

起止页码:1984-1999

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:【目的】了解健康烟株与感染青枯病烟株在根际土壤、茎杆发病部位、茎杆病健交界部位以及未发病茎杆的细菌群落结构与多样性。【方法】分别对土壤与茎杆样品中细菌的16S rRNA基因V3-V4区进行扩增,采用Illumina MiSeq测序技术对扩增片段进行高通量测序,然后对健康烟株与感染青枯病烟株不同部位细菌群落结构与多样性进行分析。【结果】感染青枯病烟株发病茎杆及根际土壤的细菌群落多样性高于健康烟株茎杆及其根际土壤样品,病健交界茎杆样品细菌群落多样性低于健康烟株。变形菌门(Proteobacteria)在所有样品中均为优势菌门;所有烟株根际土壤的优势菌门为拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和绿弯菌门(Chloroflexi);健康烟株茎杆部位的优势菌门为蓝细菌门(Cyanobacteria);感染青枯病烟株发病茎杆和病健交界茎杆部位的优势菌门为蓝细菌门(Cyanobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)。所有根际土壤样品的优势菌属为劳尔氏菌属(Ralstonia)、假单胞菌属(Pseudomonas)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)、黄杆菌属(Flavobacterium)和代尔夫特菌属(Delftia),而感染青枯病烟株根际土壤的劳尔氏菌属(Ralstonia)和假单胞菌属(Pseudomonas)相对丰度显著高于健康烟株根际土壤,鞘脂单胞菌属相对丰度显著低于健康烟株根际土壤。烟株茎杆的优势菌属为劳尔氏菌属和假单胞菌属等。感染青枯病烟株病健交界茎杆中劳尔氏菌属、肠杆菌属(Enterobacter)和泛菌属(Pantoea)相对丰度显著低于健康烟株样品。【结论】健康与感染青枯病烟株茎杆样品细菌群落的丰富度和多样性明显低于相应的根际土壤样品。较健康烟株而言,感染青枯病烟株根际土壤和茎杆样品细菌群落丰富度和多样性均表现出不同程度地增加,且根际土壤细菌群落结构变化较茎杆样品明显,而病健交界茎杆样�

关 键 词:Illumina高通量测序  细菌多样性 群落结构  烟草青枯病 茄科劳尔氏菌  

分 类 号:S435.72]

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引证文献:

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同被引文献:

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