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期刊文章详细信息

信息离散性度量方法在SARS病毒研究中的应用    

Application of a new measure of information discrepancy to the analysis of SARS coronavirus

  

文献类型:期刊文章

作  者:张文[1] 唐焕文[1] 方伟武[2] 修志龙[3]

机构地区:[1]大连理工大学计算生物学和生物信息学研究所,辽宁大连116024 [2]中国科学院应用数学研究所,北京100080 [3]大连理工大学环境与生命学院,辽宁大连116024

出  处:《计算机与应用化学》

基  金:国家自然科学基金(90103033;20176005)

年  份:2003

卷  号:20

期  号:6

起止页码:719-723

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2000、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊

摘  要:多序列比较是分子生物学中的一个基本问题,本文利用一种新型信息离散性度量方法——FDOD方法,将其应用于SARS病毒研究中,对SARS病毒与已知的三类冠状病毒的复制酶、M蛋白、N蛋白和S蛋白进行了进化分析,得出的系统发育树与现有的生物分析基本一致。同时进一步显示了FDOD方法的优点,数学基础好,不带有主观因素,能比较客观地度量生物序列间的差异,且计算过程简单快速,是分子进化研究的一种有效工具。

关 键 词:信息离散性度量方法  SARS 病毒研究 应用  非典型肺炎 序列比较  信息熵 系统发育

分 类 号:R563.1]

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