期刊文章详细信息
信息离散性度量方法在SARS病毒研究中的应用
Application of a new measure of information discrepancy to the analysis of SARS coronavirus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]大连理工大学计算生物学和生物信息学研究所,辽宁大连116024 [2]中国科学院应用数学研究所,北京100080 [3]大连理工大学环境与生命学院,辽宁大连116024
基 金:国家自然科学基金(90103033;20176005)
年 份:2003
卷 号:20
期 号:6
起止页码:719-723
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2000、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:多序列比较是分子生物学中的一个基本问题,本文利用一种新型信息离散性度量方法——FDOD方法,将其应用于SARS病毒研究中,对SARS病毒与已知的三类冠状病毒的复制酶、M蛋白、N蛋白和S蛋白进行了进化分析,得出的系统发育树与现有的生物分析基本一致。同时进一步显示了FDOD方法的优点,数学基础好,不带有主观因素,能比较客观地度量生物序列间的差异,且计算过程简单快速,是分子进化研究的一种有效工具。
关 键 词:信息离散性度量方法 SARS 病毒研究 应用 非典型肺炎 序列比较 信息熵 系统发育
分 类 号:R563.1]
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