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期刊文章详细信息

SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测    

Prediction of the secondary structure and B cell epitope for the E protein of SARS coronavirus

  

文献类型:期刊文章

作  者:吕燕波[1] 万瑛[1] 吴玉章[1]

机构地区:[1]第三军医大学免疫学教研室全军免疫研究所,重庆400038

出  处:《免疫学杂志》

年  份:2003

卷  号:19

期  号:6

起止页码:407-410

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的 预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构。方法 以SARS病毒基因组序列为基础 ,采用Gar nier Robson方法、Chou Fasman方法和Karplus Schultz方法预测E蛋白质的二级结构 ;用Kyte Doolittle方案预测蛋白质的亲水性 ;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性 ;用Jameson Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数。综合评判 ,预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位。结果 在SARS病毒E蛋白N 端的第 1~ 6、13~ 19、39~ 4 3、4 7~ 6 4区段和第 73~ 76区段有 β 折叠中心 ;第 6~ 12区段和第 6 7~ 6 9区段可能形成转角或无规则卷曲 ,是柔性区域。E蛋白N端第 2~ 13区段和第 6 1~ 74区段为B细胞优势表位区域。结论 用多参数预测SARS病毒E蛋白的二级结构和B细胞表位 。

关 键 词:SARS病毒 基因组编码  E蛋白 二级结构  B细胞表位 预测  严重急性呼吸综合征

分 类 号:R346[基础医学类]

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同被引文献:

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