期刊文章详细信息
SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测
Prediction of the secondary structure and B cell epitope for the E protein of SARS coronavirus
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]第三军医大学免疫学教研室全军免疫研究所,重庆400038
年 份:2003
卷 号:19
期 号:6
起止页码:407-410
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的 预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构。方法 以SARS病毒基因组序列为基础 ,采用Gar nier Robson方法、Chou Fasman方法和Karplus Schultz方法预测E蛋白质的二级结构 ;用Kyte Doolittle方案预测蛋白质的亲水性 ;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性 ;用Jameson Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数。综合评判 ,预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位。结果 在SARS病毒E蛋白N 端的第 1~ 6、13~ 19、39~ 4 3、4 7~ 6 4区段和第 73~ 76区段有 β 折叠中心 ;第 6~ 12区段和第 6 7~ 6 9区段可能形成转角或无规则卷曲 ,是柔性区域。E蛋白N端第 2~ 13区段和第 6 1~ 74区段为B细胞优势表位区域。结论 用多参数预测SARS病毒E蛋白的二级结构和B细胞表位 。
关 键 词:SARS病毒 基因组编码 E蛋白 二级结构 B细胞表位 预测 严重急性呼吸综合征
分 类 号:R346[基础医学类]
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