文献类型：期刊文章

作　　者：郭亚收[1] 徐晓峰[1] 李楠[1] 孙娜[2] 段丽芳[2]

Guo Yashou;Xu Xiaofeng;Li Nan;Sun Na;Duan Lifang(Department of Urology,Xianyang Central Hospital,Shaanxi Xianyang 712000,China;Department of Epidemiology and Health Statistics,School of Public Health,Shaanxi University of Chinese Medicine,Shaanxi Xianyang 712046,China)

机构地区：[1]咸阳市中心医院泌尿外科,陕西咸阳712000 [2]陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,陕西咸阳712046

出　　处：《现代肿瘤医学》

基　　金：国家自然科学基金青年项目(编号:81603420);咸阳市科学技术研究攻关项目(编号:2017k02-85)

年　　份：2019

卷　　号：27

期　　号：8

起止页码：1281-1284

语　　种：中文

收录情况：CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的:分析高危前列腺癌(high-risk prostate cancer)患者前列腺癌组织基因表达芯片数据的生物学网络调控及关键蛋白,为高危前列腺癌的诊断及治疗提供新的理论依据。方法:从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载来自于丹麦一个人群队列(正常前列腺14例,前列腺癌36例)的前列腺组织基因芯片数据,利用基因云,基因大数据分析(Gene-Cloud of Biotechnology Informs,GCBI)实验平台、GenClip2.0、Sytoscape 3.5.1等软件,筛选差异表达基因,探讨差异基因的蛋白交互作用网络和生物学通路,从转录组角度阐述高危前列腺癌发展的分子机制。结果:与正常前列腺组相比,高危前列腺癌组共有4 828个(8.83%)差异表达基因;主要涉及细胞黏附、细胞运动、细胞发育等功能。SOCS3、VEGFA、TOP2A和FGFR2基因为蛋白网络核心节点,均与高危前列腺癌的发生具有密切关系。结论:SOCS3、VEGFA、TOP2A和FGFR2基因为蛋白网络核心节点,在高危前列腺癌组中差异表达,其功能主要涉及P450细胞色素通路、β信号通路、血小板通路、细胞连接组织通路、ECM受体通路等9条通路。

关 键 词：前列腺癌 基因表达 计算生物学

分 类 号：R737.25]