期刊文章详细信息
基于数据挖掘分析酪氨酸蛋白激酶受体TYRO3在膀胱癌中的表达及临床意义
The prognostic roles of TYRO3 in bladder cancer:Evidence from data mining
文献类型:期刊文章
Qi Chuang;Zhao Hu;Chen Zhan;Cui Qiang;Guo Junqi;Lu Jun(Fujian Provincial Key Laboratory of Transplant Biology,Fuzhou General Hospital,Fujian Fuzhou 350025,China)
机构地区:[1]福建医科大学福总临床医学院(福州总医院)福建省移植生物学重点实验室,福建福州350025
基 金:国家自然科学基金(编号:81570748)
年 份:2018
卷 号:26
期 号:1
起止页码:57-61
语 种:中文
收录情况:CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的:受体酪氨酸蛋白激酶亚家族TYRO3在多种肿瘤中高表达,但其在膀胱癌中未见系统研究,本文基于数据挖掘分析TYRO3在膀胱癌及正常组织中的表达情况,并进一步探讨TYRO3对膀胱癌预后的影响。方法:利用Oncomine数据库分析TYRO3基因在膀胱癌组织中mRNA水平的变化。通过Fire Browse分析人体正常组织和其相应的肿瘤组织中TYRO3基因的表达差异。经Meth HC分析膀胱癌和正常膀胱组织中TYRO3基因DNA启动子区甲基化水平的差异。利用Onco Lnc做TYRO3基因的表达水平与膀胱癌患者生存期的相关性分析。在String-DB数据库中探索TYRO3基因在细胞信号转导通路中的位置以及与其关系密切的上下游基因。结果:与正常膀胱组织相比,膀胱癌组织中TYRO3基因在mRNA水平呈高表达,TYRO3基因DNA启动子区甲基化水平低,TYRO3基因的表达水平与膀胱癌患者的总体生存时间呈负相关。GAS6、PHLPP1、PHLPP2、PIK3R1、PROS1、SOCS1、ACACA、ACACB、LRGUK、PI3、CCNH等基因与TYRO3有明显的相互作用。结论:大样本数据挖掘能迅速地获取浸润性膀胱癌组织中TYRO3表达的相关信息,为深入研究膀胱癌术后复发的监测和增加新的药物治疗靶点奠定基础。
关 键 词:膀胱癌 TYRO3 数据库分析
分 类 号:R737.14]
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