文献类型：期刊文章

作　　者：刘青[1] 严向东[1]

机构地区：[1]华中科技大学计算机学院计算机应用系,武汉430074

出　　处：《计算机工程与应用》

基　　金：国家自然科学基金重大研究计划项目资助(编号:90203011)

年　　份：2003

卷　　号：39

期　　号：24

起止页码：69-71

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2000、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、INSPEC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：随着基因组研究的发展,利用机器学习方法进行基因识别被广泛使用,这些方法包括神经网络算法、基于规则的方法、决策树、概率推理等。文章描述了一种基于隐马尔科夫模型的基因识别系统,介绍了EM训练算法和Viterbi序列分析算法,该系统运用Burset&Guigo的公共数据集进行测试,核苷识别的Sn和Sp两个参数分别可以达到68%和88%,外显子识别的Sn和Sp参数达到60%和63%。

关 键 词：隐马尔科夫模型 基因识别 EM算法 VITERBI算法 机器学习方法

分 类 号：TP18]