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用SARS冠状病毒全基因组芯片杂交方法分析SARS-CoV
Analysis of SARS Coronavirus by Oligonucleotide(70mer) Microarray Hybridization
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制研究所病毒基因工程国家重点实验室,北京100052 [2]本元正阳基因技术股份有限公司,北京100176
年 份:2003
卷 号:23
期 号:7
起止页码:89-93
语 种:中文
收录情况:CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:为从临床样品中检测和分析SARS CoV病毒打基础 ,并为分析SARS CoV病毒的复制和转录等机理提供一种有效方法。以SARS冠状病毒TOR2株序列作为标准设计和制备一种覆盖SARS冠状病毒全基因组的寡聚核苷酸芯片 ,探针长度为 70nt,每相邻的探针序列重复 2 5nt,共660条。用该芯片分析了细胞培养的SARS CoV病毒总RNA、7个SARS CoV病毒的基因克隆片段。对RNA样品用随机引物进行反转录PCR获得cDNA。对DNA用随机引物扩增和dUTP cy3标记。结果用这种芯片杂交检测SARS CoV病毒RNA可见阳性信号呈全基因组分布 ,并且有多处连续的阳性信号点 ;用正常人的白细胞RNA为对照 ,杂交未出现明显阳性信号。检测 7个SARS CoV病毒基因克隆片段 ,在该片段相应的探针区段出现连续阳性信号点。这种方法可有效地检测和分析样品中SARS冠状病毒全基因组的信息。
关 键 词:SARS冠状病毒 全基因组 杂交方 SARS-COV 基因芯片
分 类 号:R511] Q503[临床医学类]
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