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期刊文章详细信息

鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码    

Genus Sinopotamon DNA barcoding in Poyang lake basin

  

文献类型:期刊文章

作  者:徐武杰[1] 邹节新[1,2] 白俊[1] 朱春潮[1,2] 石林波[1] 张小燕[1] 张萌[1] 汪雁[3,2] 周宪民[1,2]

机构地区:[1]南昌大学医学部人体寄生虫学教研室,江西南昌330006 [2]南昌大学鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室,江西南昌330047 [3]南昌大学医学部医学遗传与细胞生物学实验室,江西南昌330006

出  处:《南昌大学学报(理科版)》

基  金:国家自然科学基金项目(81260257;81160207;31460156;31560179);江西省自然科学基金(20132BAB205059);江西省医学科研项目(20122025);江西省教育厅项目(GJJ12084);南昌大学研究生创新专项资金(CX2015180)

年  份:2015

卷  号:39

期  号:4

起止页码:402-408

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、IC、RCCSE、ZGKJHX、ZMATH、核心刊

摘  要:探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。

关 键 词:鄱阳湖流域 华溪蟹属 DNA条形码 COI

分 类 号:S917.4[水产类]

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