期刊文章详细信息
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]南昌大学医学部人体寄生虫学教研室,江西南昌330006 [2]南昌大学鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室,江西南昌330047 [3]南昌大学医学部医学遗传与细胞生物学实验室,江西南昌330006
基 金:国家自然科学基金项目(81260257;81160207;31460156;31560179);江西省自然科学基金(20132BAB205059);江西省医学科研项目(20122025);江西省教育厅项目(GJJ12084);南昌大学研究生创新专项资金(CX2015180)
年 份:2015
卷 号:39
期 号:4
起止页码:402-408
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、IC、RCCSE、ZGKJHX、ZMATH、核心刊
摘 要:探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
关 键 词:鄱阳湖流域 华溪蟹属 DNA条形码 COI
分 类 号:S917.4[水产类]
参考文献:
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引证文献:
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同被引文献:
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