文献类型：期刊文章

作　　者：陈泽斌[1,2] 李冰[3] 王定康[4] 余磊[1] 徐胜光[1] 任禛[1] 靳松[1] 张永福[1] 彭声静[1]

机构地区：[1]昆明学院农学院,云南昆明650214 [2]云南省都市特色农业工程技术研究中心,云南昆明650214 [3]中国科学院昆明动物研究所,云南昆明650223 [4]昆明学院生命科学与技术系,云南昆明650214

出　　处：《江苏农业学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(41361056);云南省教育厅科学研究项目(2014Y390);云南省都市型休闲农业工程技术研究中心项目(XXNY1402);昆明学院大学生科学研究项目(XJD15054);云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目

年　　份：2015

卷　　号：31

期　　号：5

起止页码：1129-1133

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CSCD、CSCD_E2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：应用Illumina Mi Seq高通量测序技术测定核桃内生细菌的16S r DNA-V4变异区序列,使用Uparse等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析内生细菌的丰度和α-多样性。获得了用于分析的有效序列63 183条,OTU数为103。稀释曲线表明测序深度充分,OTU数量接近于饱和。核桃样品的Chao1指数为105.143,Shannon多样性指数为1.823。核桃内生细菌主要分布于鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas,27.27%)、盐单胞菌属(Halomonas,27.27%)、土壤杆菌属(Agrobacterium,45.45%),这3个属是核桃内生细菌优势菌属。

关 键 词：ILLUMINA MI Seq  高通量测序 核桃 内生细菌 多样性  

分 类 号：S664.1]