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期刊文章详细信息

基因表达数据聚类分析结果的评价方法研究    

An Novel Method for Evaluation of Clustering Results for Gene Expression Data

  

文献类型:期刊文章

作  者:易东[1] 杨梦苏[2] 李辉智[3] 黄明辉[2] 王文昌[1]

机构地区:[1]第三军医大学卫生统计学教研室,400038 [2]香港城市大学基因组科技应用研究中心 [3]西南政法学院刑侦学院电子技术教研室,400031

出  处:《中国卫生统计》

年  份:2002

卷  号:19

期  号:6

起止页码:332-335

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2000、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的 本文探讨基因表达数据聚类分析结果的评价方法 ,提供一种最佳聚类结果的判别准则。方法 从数据结构 (内部信息 )和功能分类 (外部信息 )两个方面对聚类结果进行评判。即一方面 ,采用Entropy(信息熵 )评判法 ,考察聚类结果与部分已知功能基因分类的符合程度 ;另一方面 ,采用adjust- FOM评价法 ,从数据结构的本身进行评价。我们综合两种方法得到一种新的评价方法 ,并称此方法为Entropy- FOM评价方法。结果 将该方法应用于Lyer的血清数据集和Ferea的酵母数据集对聚类分析结果进行了评价 ,给出了六种聚类方法的adjust- FOM图和Entropy- FOM图。结论 通过大量计算结果提示 。

关 键 词:基因表达 聚类分析 Entropy-FOM评价  Entropy评价  

分 类 号:R195]

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同被引文献:

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