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华南地区三株新城疫地方强毒株的序列测定及其系统发育分析
Sequencing of HN Gene of Three Newcastle Disease Virus Isolates from South China and Phylogenic Analysis
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]深圳出入境检验检疫局动植食中心动检室,深圳518000 [2]华南农业大学动物医学系农业部养禽与禽病重点开放实验室,广州510642
基 金:广东省自然科学基金资助(980160)
年 份:2003
卷 号:34
期 号:1
起止页码:67-71
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2011_2012、DOAJ、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:用设计的特异性引物,通过一步法RT-PCR扩增出5个毒株的897bp片段,对其中的3株病毒cDNA分析表明:各毒株的半胱胺酸位点和个数及糖基化位点基本没有改变。各毒株在抗原决定簇氨基酸位点HN基因346~353处的碱基突变甚多,且氨基酸也出现了部分的突变。针对HN基因897bp片段构建了相应的系统发育树,系统发育分析表明:中国(华南)地区NDV各毒株与欧美国家的Ⅱ至Ⅴ基因群明显分离,遗传规律较远;NDV WS1和NDV HY与台湾省NDV各毒株归属为一组,与中国毒株的遗传距离较近,均属新近出现的基因型Ⅶ型,NDⅦ型在远东和西欧(Ⅶb)和及中东和南非(Ⅶa)广泛存在,可能形成了ND的第4次大流行。这些一方面说明NDV的变异可能已突破种源屏障,在鸡与鹅之间进行相互传播;另一方面说明中国古老的NDV毒株仍然持续存在,并逐渐向强毒株突变,与其他新出现的基因型毒株"共循环"。
关 键 词:华南地区 新城疫地方强毒株 新城疫病毒 HN基因 RT-PCR 系统发育 测序
分 类 号:S852.659.5] S858.315.3[动物医学类]
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