期刊文章详细信息
一种基于ITR序列的羊痘病毒TaqMan探针荧光PCR检测方法的建立
Development of a TaqMan probe fluorescent PCR assay method based on Capripoxvirus ITR sequence
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]天津出入境检验检疫局动植物与食品检测中心 [2]中国兽药监察所
基 金:国家质检总局科技计划项目(2010IK017)
年 份:2018
卷 号:0
期 号:3
起止页码:233-236
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAS、RCCSE、核心刊
摘 要:为了建立一种快速检测羊痘病毒的方法,试验根据羊痘病毒[绵羊痘病毒(SPPV)和山羊痘病毒(GTPV)]末端反向重复(ITR)序列的保守区设计了1对特异引物和TaqMan探针,通过优化反应体系建立了一种检测羊痘病毒的TaqMan探针荧光PCR检测方法。结果表明:该方法对羊痘病毒具有良好的特异性,不与猪痘病毒(SWPV)、鸡痘病毒(FPV)、羊传染性脓疱皮炎病毒(ORFV)及口蹄疫病毒(FMDV)发生交叉反应。该方法对质粒标准对照(PCR^2.1-GPTV-ITR)的最适线性检测范围为2.3×10~1~2.3×10~8拷贝/μL,标准曲线方程为Y=-3.416 2X+38.605,相关系数(R^2)为0.999 9,检测下限为23拷贝数。对3个不同浓度的PCR^2.1-GPTV-ITR进行组内试验和组间试验检测,每个浓度的重复试验Ct值的变异系数均小于1.5%,具有良好的重现性。用该方法对来自安徽、广西和天津地区的36份临床样本进行羊痘病毒检测,其中18份样本羊痘病毒核酸检测为阳性。说明本方法可用于羊痘病毒快速、准确检测。
关 键 词:羊痘病毒 末端反向重复(ITR)序列 荧光PCR检测方法 TaqMan探针荧光PCR 标准曲线
分 类 号:S852.654]
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