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幽门螺杆菌16SrDNA指纹图和PCR-RFLP基因分型研究
Genotyping study on Helicobacter pylori by 16S rDNA fingerprinting and ureC PCR-RFLP patterns
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华中科技大学同济医学院公共卫生学院,武汉430030 [2]郑州大学医学院公共卫生学院 [3]河南省分子医学重点学科开放实验室
年 份:2003
卷 号:19
期 号:1
起止页码:72-75
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2000、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、JST、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的 探讨我国幽门螺杆菌 (Helicobacterpylori,Hp)的基因多态性及其与相关疾病之间的关系。 方法 应用PCR掺入法制备 16SrRNA基因探针 ,建立 16SrDNA指纹图技术和尿素酶C(ureC)基因的PCR -RFLP法 ,并结合统计学软件进行聚类分析 ,对临床分离的 14株Hp进行基因分型。结果 14株Hp的 16SrDNA指纹图谱显示 10个HaeⅢ杂交带型和 12个HindⅢ杂交带型 ;ureC基因的变异度较小 ,14株Hp中有 12株PCR -RFLP图谱完全一致。通过杂交结果示意图和SPSS10 0软件进行聚类分析 ,HaeⅢ、HindⅢ及两种酶杂交结果的综合 ,均将 14株Hp分为两型。两种方法结果综合进行聚类分析 ,14株Hp在基因水平上分为三型。结论 差异显著的DNA指纹图谱说明了不同Hp菌株间基因组结构的高度变异性。 16SrDNA指纹图谱较ureC基因的PCR -RFLP谱型更敏感地表达Hp各菌株的变异 ,可准确有效地对Hp作出基因分型。
关 键 词:幽门螺杆菌 16S RDNA 尿素酶C基因 PCR-RFLP 基因分型 聚类分析
分 类 号:R573]
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