文献类型：期刊文章

作　　者：李育先[1] 夏瑞燕[1] 王金朋[1] 王希胤[1]

机构地区：[1]华北理工大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山063000

出　　处：《河北联合大学学报（自然科学版）》

基　　金：华北理工大学研究创新项目(2015S24);华北理工大学大学生创新创业训练计划项目(X2015165)

年　　份：2016

卷　　号：38

期　　号：4

起止页码：38-44

语　　种：中文

收录情况：CAS、普通刊

摘　　要：以葡萄和咖啡的基因组为研究对象,基于比较基因组学和生物信息学的研究方法,通过比较基因组结构上的同源关系,确定物种进化中基因组加倍的性质,获取由全基因组加倍产生的重复基因。研究表明:葡萄和咖啡都发生过一次古老的全基因三倍化事件,产生了大量的同源重复基因;研究获得了种内、种间的同源基因,对物种间的同源基因进行了区分,并构建了葡萄和咖啡基因组的联合比对图谱,对这一结果进行形象地展示;在葡萄、咖啡基因组内分别获取了1 427(5.4%)个、1 543(6.0%)个由多倍化产生的重复基因对,在2个物种基因组间获取了7 462个重复基因对,为深入研究葡萄和咖啡基因组的进化提供了参考。

关 键 词：葡萄 咖啡 全基因加倍  重复基因 同源片段  

分 类 号：S663.1] S571.2]