期刊文章详细信息
甜玉米自交系SNP标记遗传多样性及群体遗传结构分析
Analysis of genetic diversity and population genetic structure of sweet maize inbred lines using SNP markers
文献类型:期刊文章
XIA Xinran;KUANG Huiyun;SUN Pingdong;LU Yuan;ZHENG Hongjian;WANG Hui;ZHANG Zhonglin;HU Yingxiong(Development Center of Plant Germplasm Resources,College of Life Sciences,Shanghai Normal University,Shanghai 201418,China;Crop Breeding and Cultivation Research Institute,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 201403,China;CIMMYT-China Specialty Maize Research Center,Shanghai 201403,China;Shanghai Engineering Research Center of Specialty Maize,Shanghai 201403,China)
机构地区:[1]上海师范大学生命科学学院,植物种质资源开发中心,上海201418 [2]上海市农业科学院作物育种栽培研究所,上海201403 [3]CIMMYT-中国特用玉米研究中心,上海201403 [4]上海特用玉米工程技术研究中心,上海201403
基 金:上海市农业科技创新项目(2023-02-08-00-12-F04578);上海市农业科技创新项目(2024-02-08-00-12-F00056);上海市农业科技创新项目[沪农科(T2023201)];鲜食糯玉米种质资源评价规范(Y-ZZ-004-2024);上海市青年科技启明星项目(23QB1403100)。
年 份:2025
卷 号:41
期 号:1
起止页码:1-6
语 种:中文
收录情况:普通刊
摘 要:为了解甜玉米的种质遗传基础,提高甜玉米优良品种选育效率,基于重测序手段进行基因型分型,获得20648个高质量SNP位点,并基于SNP位点对167份甜玉米自交系进行了遗传多样性和群体遗传结构分析。结果表明:167份甜玉米自交系的期望杂合度为0.09—0.50,平均值0.23;观测杂合度为0.0133—0.9521,平均值0.2495。主等位基因频率的变化范围为0.50—0.95,平均值0.85。多态性信息含量的变化范围为0.095—0.500,平均值0.228。群体遗传结构分析表明:当K=3时,交叉验证错误率最低,结合系统发育树,将167份甜玉米自交系划分为3个类群,该类群划分结果与基于种质来源(热带、亚热带和温带)划分结果基本一致。供试群体中甜玉米自交系整体上遗传变异较为丰富,部分类群有较好的应用潜力。本研究可为甜玉米新品种选育和杂种优势群构建提供技术依据。
关 键 词:甜玉米 重测序 SNP标记 遗传多样性 群体遗传结构
分 类 号:S513.03]
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