文献类型：期刊文章

作　　者：李思楠[1] 苏安玉[2] 于以成[1] 张超[1] 马彦龙[1] 王玲爽[1] 金杨媚[1] 李文滨[1] 武小霞[1]

机构地区：[1]大豆生物学教育部重点实验室东北农业大学农学院,哈尔滨150030 [2]东北农业大学资源与环境学院,哈尔滨150030

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：黑龙江省自然科学重点基金项目(ZD201117);优质高蛋白大豆新品种选育及推广应用(2015RQXXJ018)哈尔滨市优秀学科带头人项目;转基因重大专项(2013ZX08004-001)共同资助

年　　份：2015

卷　　号：34

期　　号：10

起止页码：2187-2193

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：生长素响应因子(auxin response factor,ARF)在植物生长和发育中起到了非常关键的作用。本研究利用实验室前期转录组测序技术得到的差异表达基因Gm ARF,并应用PLACE数据库、Interpro、expasy数据库、SOPMA、Phyre、Protscale、MEGA5等工具对该基因的启动子元件、编码氨基酸的功能、亲水性、等电点、二级结构、三级结构、同源进化树及KEGG通路进行分析。并研究了对其在外源激素处理下的表达分析。结果表明:其前体序列具有很多与再生相关的响应元件,理论等电点为6.28,稳定系数为60.45,属于不稳定蛋白,Gm ARF编码的蛋白属于生长素蛋白,有一个B3超家族的保守结构域,一个生长素响应因子,以及一个PB1结构域,二级结构中23.33%为α螺旋结构,49.67%为不规则卷曲,8.59%为α转角,18.42%为延伸链,三级结构共有194个氢键,9个螺旋结构,32个转角结构,亲水性平均系数为-0.497,Gm ARF基因与苜蓿亲缘较近,其KEGG通路属于植物激素信号调节通路中色氨酸代谢途径,q RT-PCR结果表明在外源激素处理下,Gm ARF的表达量显著提高,说明Gm ARF基因作为正调控因子参与大豆再生过程。本研究的初步结果对今后进一步研究该基因的功能,提高大豆再生率,建立稳定的大豆再生体系提供了理论基础。

关 键 词：GmARF  大豆 再生  生物信息学

分 类 号：S565.1]