文献类型：期刊文章

作　　者：黎帮勇[1] 胡尚连[1] 曹颖[1] 徐刚[1]

机构地区：[1]西南科技大学植物细胞工程实验室四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心,绵阳621010

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：国家自然科学基金青年基金项目(31400257;31400333);四川省"十二五"重点公关资助项目(2011YZGG-10);四川省应用基础研究基金资助项目(2013JY0182);四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心基金资助(12zxsk07;13zxsk01);西南科技大学研究生创新基金资助(15ycx087)共同资助

年　　份：2015

卷　　号：34

期　　号：8

起止页码：1769-1777

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物对非生物胁迫、激素信号应答以及器官形成中发挥重要作用。到目前为止,毛竹NAC转录因子很少被研究,为进一步研究毛竹NAC转录因子家族,本研究利用生物信息学方法,对125条毛竹NAC蛋白序列的系统发生、氨基酸组成、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析。系统进化树分析结果表明,125条毛竹NAC蛋白被划分为17个亚族,毛竹NAC结构域中包含8个保守的NAM基序,主要分布在N端的。不同亚族的毛竹NAC蛋白在氨基酸数目以及氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异,二级结构主要由随机卷曲构成,α-螺旋和β-转角在所有毛竹NAC蛋白中均有分布,且在各亚族中没有明显的差异。125条毛竹NAC蛋白的三级结构绝大部分相似。本研究结果为毛竹NAC基因家族功能的进一步研究提供了理论依据。

关 键 词：毛竹 NAC基因家族  生物信息学

分 类 号：S795.7]