文献类型：期刊文章

作　　者：亚华金[1,2] 田金红[1] 沈莲文[1] 王大玮[1]

YA Hua-jin;TIAN Jin-hong;SHEN Lian-wen;WANG Da-wei(College of Forestry,Southwest Forestry University/Key Laboratory of Ministry of Education for Conservation and Utilization of Mountain Forest Resources in Southwest China/Key Lab for Forest Genetic and Tree Improvement&Propagation in Universities of Yunnan Province,Kunming 650224,China;Yunnan Institute of Tropical Crops,Xishuangbanna,Yunnan 666100,China)

机构地区：[1]西南林业大学林学院/西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室/云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,昆明650224 [2]云南省热带作物科学研究所,云南西双版纳666100

出　　处：《西南农业学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(32060350);云南省万人计划青年拔尖人才专项(YNWR-QNBJ-2020-230)。

年　　份：2024

卷　　号：37

期　　号：9

起止页码：2003-2011

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2023、CAB、CSCD、CSCD_E2023_2024、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】为鉴定和分析云南栘[木衣](Docynia delavayi)bHLH(DdbHLH)转录因子家族,筛选与果皮花青素生物合成相关的DdbHLH转录因子。【方法】基于云南栘[木衣]红、绿2种颜色果皮的转录组数据,对DdbHLH转录因子家族进行鉴定,并通过生物信息学工具对其bHLH保守结构域、蛋白理化性质、系统进化发育关系以及基因的表达情况进行分析。【结果】在云南栘[木衣]中共鉴定到177个DdbHLH转录因子家族成员,其氨基酸长度为69~699 aa,相对分子质量为7.965~75.419 kDa,平均理论等电点为6.93,大部分属于不稳定亲水蛋白。系统发育进化关系显示,DdbHLH转录因子与拟南芥AtbHLH转录因子共同聚类的有15个亚族,17个DdbHLH转录因子聚类到与花青素相关的第2亚族;结合红、绿果皮中DdbHLH基因表达情况,初步筛选11个在红色果皮中表达量较高的成员,对这11个成员进行差异表达分析,最终获得2个可能参与调控花青素生物合成的DdbHLH基因;再对这2个DdbHLH基因进行RT-qPCR检测,结果显示其相对表达量与转录组测序情况基本一致,证实转录组测序结果的可靠性。【结论】从云南栘[木衣]红、绿果皮转录组数据中鉴定到177个DdbHLH转录因子家族成员,筛选到2个转录因子(DdbHLH68、DdbHLH150)与果皮花青素生物合成相关的成员,为DdbHLH转录因子家族在调控云南栘[木衣]果皮色泽方面的研究奠定基础。

关 键 词：云南栘[木衣]  bHLH转录因子  转录组 果皮颜色 表达分析  生物信息学

分 类 号：S792.99]