文献类型：期刊文章

作　　者：刘璇[1] 陈虞超[1] 郭生虎[1] 钟楠[1] 石磊[1] 甘晓燕[1]

LIU Xuan;CHEN Yuchao;GUO Shenghu;ZHONG Nan;SHI Lei;GAN Xiaoyan(Research Center of Agricultural Biotechnology,Ningxia Academy of Agriculture and Forestry Sciences,Ningxia Key Laboratory of Agricultural Biotechnology,Yinchuan 750002,Ningxia,China)

机构地区：[1]宁夏农林科学院农业生物技术研究中心/宁夏农业生物技术重点实验室,宁夏银川750002

出　　处：《草业科学》

基　　金：宁夏回族自治区重点研发计划项目(2022BBF03033)。

年　　份：2024

卷　　号：41

期　　号：10

起止页码：2316-2329

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2023、CAB、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：芦竹(Arundo donax)生长周期短,纤维素及粗蛋白含量高,是一种新型的经济能源饲草,具有广阔的应用前景。TCP是一类植物特有的转录因子,在调控植物生长发育过程中具有重要作用,但目前该基因家族在芦竹中的分布以及生物学功能未见报道。本研究以芦竹为对象,利用生物信息学方法对AdTCP基因家族的基本理化性质、染色体定位、基因间的共线性关系、基因结构、蛋白的保守基序、多序列比对以及与其他物种的亲缘进化关系进行了系统分析,并运用实时荧光定量PCR测定了盐胁迫下7个AdTCP基因的相对表达量。结果表明,芦竹含有37个AdTCP基因,分布在不同染色体上,其蛋白理化性质各不相同,且均为亲水性、不稳定蛋白,多数定位在细胞核中。AdTCP家族基因结构中均只含有外显子,无内含子,共线性分析鉴定出22个片段复制基因对;其家族蛋白包含15个不同的保守基序,序列相似性为30.52%。通过与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)TCP基因进行亲缘关系比较,结果发现82个TCPs可以分为TCP-P和TCP-C两大亚家族,其中TCP-P仅包含PCF分支,而TCP-C包含CYC与CIN两个分支。随着盐胁迫浓度的升高,7个AdTCP基因的表达量呈现先上升后下降的趋势,说明AdTCP参与盐胁迫响应过程。本研究为解析芦竹基因功能及创制芦竹新种质奠定了基础。

关 键 词：芦竹 TCP转录因子  基因家族鉴定  盐胁迫 表达分析  

分 类 号：S795.8]