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期刊文章详细信息

芸薹属植物KNOX1基因家族的鉴定及生物信息学分析    

Identification and Bioinformatics Analysis of KNOX1 Gene Family in Brassica

  

文献类型:期刊文章

作  者:刘皓琦[1] 殷质源[1] 仇梦萍[1] 许晔[1] 王晗[1]

Liu Haoqi;Yin Zhiyuan;Qiu Mengping;Xu Ye;Wang Han(Jiangsu Key Laboratory for Biofunctional Molecules,College of Life Science and Chemistry,Jiangsu Second Normal University,Nanjing,211200)

机构地区:[1]江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,江苏省生物功能分子重点建设实验室,南京211200

出  处:《分子植物育种》

基  金:国家自然科学基金项目(31700280);江苏省自然科学基金资助项目(BK20170756);江苏省大学生创新创业训练计划项目(202214436076Y)共同资助。

年  份:2024

卷  号:22

期  号:20

起止页码:6661-6674

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2023、CAB、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用,同源异型盒基因(Class 1 KNOTTED-like homeobox,KNOX1)作为其中的一个分类,在调节和保持茎尖分生组织细胞活力方面,特别是在叶的生长和表型的形成中起到了非常关键的作用。为了进一步研究KNOX1基因家族在芸薹属植物不同组织发育中的作用,本研究利用生物信息学分析对芸薹属部分植物全基因组KNOX1基因家族成员进行鉴定,并对其基因结构、基因共线性关系、保守结构域和系统进化关系等情况进行分析。结果表明,在芸薹属植物白菜、甘蓝、甘蓝型油菜、芥菜和黑芥中共获得37个KNOX1基因,均编码不稳定的亲水性蛋白,所有蛋白均包含KNOX1、KNOX2、ELK和Homeobox KN的特征性保守结构域。通过结合进化和结构分析,发现芸薹属植物KNOX1蛋白的种间同源性非常高,但KNOX1位点不完全符合三倍体进化学说。同时从基因表达模式分析发现,不同芸薹属植物的KNOX1基因在根、茎、叶、花和种子中表达量有所不同。本研究将为进一步揭示芸薹属植物中KNOX1基因的具体功能提供相关的理论依据。

关 键 词:芸薹属 KNOX1基因家族  生物信息学分析 基因结构

分 类 号:S63]

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