期刊文章详细信息
基于无监督学习方法的细胞膜内单分子扩散运动分析:胆固醇对模型膜和活细胞膜流动性的不同影响 ( EI收录)
Analysis of single-molecule diffusion movement in cell membrance based on unsupervised learning methods:Different effects of cholesterol on flowability of model membrane and living cell membrane
文献类型:期刊文章
Tan Jin-Peng;Zhang Wan-Ting;Xu Cheng;Lu Xue-Mei;Zhu Wen-Sheng;Yang Kai;Yuan Bing(School of Mathematics and Statistics,Northeast Normal University,Changchun 130024,China;Songshan Lake Materials Laboratory,Dongguan 523808,China;Center for Soft Condensed Matter Physics and Interdisciplinary Research,School of Physical Science and Technology,Soochow University,Suzhou 215006,China;School of Optical and Electronic Information,Suzhou City University,Suzhou 215104,China;Jiangsu Key Laboratory of Frontier Material Physics and Devices,Suzhou City University,Suzhou 215006,China)
机构地区:[1]东北师范大学数学与统计学院,长春130024 [2]松山湖材料实验室,东莞523808 [3]苏州大学物理科学与技术学院,软凝聚态物理及交叉研究中心,苏州215006 [4]苏州城市学院光学与电子信息学院,苏州215104 [5]苏州大学,前沿材料物理与器件省高校重点实验室,苏州215006
基 金:国家自然科学基金(批准号:12274307,32230063,12347102,22307090,22203059);广东省基础与应用基础研究基金(批准号:2023A1515011610);江苏省自然科学基金(批准号:BK20210100);前沿材料物理与器件省高校重点实验室(苏州大学)(批准号:KJS2131)资助的课题。
年 份:2024
卷 号:73
期 号:18
起止页码:278-288
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2023、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、EAPJ、EI、INSPEC、JST、RCCSE、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZMATH、核心刊
摘 要:单分子运动追踪是研究软物质体系尤其是生命体系动力学过程和分子相互作用的重要方法,但如何理解生命体系中单分子运动行为的复杂性仍是一个巨大的挑战.针对这一问题,本工作提出了一种可对单分子轨迹进行高效识别和分类的、基于无监督学习的“两步归类法”:首先利用熵约束最小二乘法对扩散轨迹的受限程度进行区分,继而通过统计检验将非受限轨迹划分为亚扩散、正常扩散和超扩散等不同运动模式类型.利用该方法,本工作解析了DOPC模型细胞膜和活细胞膜内的单分子扩散运动特征,揭示了胆固醇成分对二者的差异影响.结果显示:模型膜和活细胞膜均包含多种不同的扩散模式;在DOPC模型膜体系中,胆固醇成分会阻碍膜内的分子扩散运动,且阻碍程度与胆固醇含量正相关;在活细胞体系中,分子运动速率显著低于模型膜体系,并且,胆固醇的去除会进一步减慢分子扩散速率.本研究有助于从单分子运动角度深入理解生物分子运动行为的复杂性及其对体系环境的依赖性.
关 键 词:单分子运动 无监督学习 模型细胞膜 胆固醇
分 类 号:Q241]
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