期刊文章详细信息
云南栘[木衣]WOX基因家族的鉴定与表达分析
Identification and Expression Analysis of WOX Gene Family in Docynia delavayi
文献类型:期刊文章
HE Yuheng;WANG Dawei(Key Laboratory for Forest Genetic and Tree Improvement&Propagation in Universities of Yunnan Province,College of Forestry,Southwest Forestry University,Kunming 650224,China;Key Lab of Ministry of Education for Conservation and Utilization of Mountain Forest Resources in Southwest China,College of Forestry,Southwest Forestry University,Kunming 650224,China)
机构地区:[1]西南林业大学林学院,云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,昆明650224 [2]西南林业大学林学院,西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室,昆明650224
基 金:国家自然基金项目(32060350);云南省万人计划青年拔尖人才专项(YNWR-QNBJ-2020-230)。
年 份:2024
卷 号:43
期 号:8
起止页码:36-45
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2023、CAB、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为探究云南栘[木衣]WOX基因家族成员的功能和表达模式,本研究通过生物信息学方法对云南栘[木衣]WOX基因进行全基因组鉴定。结果表明,云南栘[木衣]基因组中共有20个DdeWOX基因,且不均匀地分布在12条染色体上;家族成员的长度在176~877个氨基酸之间,含有2~9个内含子,编码17~50个氨基酸;系统进化结果显示DdeWOX基因可分为3个进化分支。分析4个果实发育时期及5个种子萌发阶段的转录组数据,并从中随机挑选6个基因进行RT-qPCR测定以验证转录组的整体准确性。发现DdeWOX13a/DdeWOX11在果实发育的不同时期内具有较高表达量,推测这两个基因可能参与云南栘[木衣]的果实发育过程,且二者可能存在功能冗余;另外DdeWOX2在种子萌发的成苗期内具有较高表达,推测其可能参与调控种子萌发过程;值得注意的是DdeWOX13a在种子萌发阶段也有较高表达,推测该基因可能同时对种子萌发及果实发育具有调控作用。
关 键 词:云南栘[木衣] WOX基因家族 生物信息学 表达分析
分 类 号:S792.99]
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