文献类型：期刊文章

作　　者：傅子玥[1] 张道锋[1] 黄梦涵[1] 李敬霖[1] 苏浩辰[1] 李文均[1,2,3]

FU Ziyue;ZHANG Daofeng;HUANG Menghan;LI Jinglin;SU Haochen;LI Wenjun(Institute of Marine Biotechnology and Bio-resource Utilization,College of Oceanography,Hohai University,Nanjing 210098,Jiangsu,China;State Key Laboratory of Pest Biocontrol and Resource Utilization,School of Life Sciences,Sun Yat-Sen University,Guangzhou 510275,Guangdong,China;State Key Laboratory of Desert and Oasis Ecology,Xinjiang Institute of Ecology and Geography,Chinese Academy of Sciences,Urumqi 830011,Xinjiang,China)

机构地区：[1]河海大学海洋学院海洋生物研究所,江苏南京210098 [2]中山大学生命科学学院有害生物控制与资源利用国家重点实验室,广东广州510275 [3]中国科学院新疆生态与地理研究所荒漠与绿洲生态国家重点实验室,新疆乌鲁木齐830011

出　　处：《微生物学报》

基　　金：国家自然科学基金(31900001);江苏省海洋科技创新项目(JSZRHYKJ202209)。

年　　份：2024

卷　　号：64

期　　号：5

起止页码：1593-1606

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2023、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、JST、PUBMED、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】潮间带海水中分离获得一株具有水解多糖能力的菌株FZY0027,分析其对不同多糖的水解能力和基因组特征。【方法】通过形态观察、16S rRNA基因测序和基于Illumina NovaSeq和Oxford Nanopore PromethION测序技术全基因组测序对菌株FZY0027进行鉴定。使用dbCAN、EasyCGTree、BRIG和Easyfig等生物信息学软件将菌株FZY0027和降解糖噬糖菌(Saccharophagus degradans)2-40^(T)进行比较。使用3,5-二硝基水杨酸(3,5-dinitrosalicylic acid,DNS)法测定多糖水解活性。【结果】菌株FZY0027与S.degradans 2-40^(T)的16S rRNA基因序列相似度达到99.9%,初步鉴定为降解糖噬糖菌(S.degradans)FZY0027。该菌株在水解淀粉、木聚糖和甘露聚糖时产生的还原糖浓度最高,分别为2.28、1.75和1.10 mg/mL。菌株FZY0027基因组全长5178381 bp,共编码4156个基因,G+C含量为45.8%。菌株FZY0027与S.degradans 2-40^(T)的平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)、平均氨基酸一致性(average amino acid identity,AAI)和DNA-DNA分子杂交(digital DNA-DNA hybridization,dDDH)值分别为96.5%、96.7%和70.0%。经碳水化合物活性酶数据库注释获得303个基因,其中,菌株FZY0027和S.degradans 2-40^(T)分别有糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)结构域的基因137个和130个。菌株FZY0027具有多个参与淀粉、木聚糖等多糖水解的基因,这与菌株FZY0027对淀粉和木聚糖的水解能力强的结果一致。然而,与S.degradans2-40^(T)相比,菌株FZY0027在实验条件下只能水解少数多糖,这可能需要特定的诱导条件才能充分发挥其多糖水解能力。【结论】菌株FZY0027是一株多能型多糖水解菌,具有潜在开发价值。

关 键 词：降解糖噬糖菌  多糖水解活性  基因组 生物信息学分析

分 类 号：Q933]